RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 USP16Q9Y5T5 823 aa8.76□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 ICE2Q659A1 982 aa8.76□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.76□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 NECTIN2Q92692 538 aa8.75□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 CACNA1FO60840 1977 aa8.75□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 OGFRQ9NZT2 677 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 MMP10P09238 476 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 GYS1P13807 737 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 GUCY2CP25092 1073 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 NFE2L2Q16236 605 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 POTEDQ86YR6 584 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 BORCS6Q96GS4 357 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 ANXA1P04083 346 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 SSFA2P28290 1259 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 DDR1Q08345 913 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 RFC4P35249 363 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 APAF1O14727 1248 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 RPS6KA4O75676 772 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 ZNF853P0CG23 659 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 COL15A1P39059 1388 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 NBPF26B4DH59 902 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 SEC24BO95487 1268 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 POLD1P28340 1107 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 TERF2Q15554 542 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 CASC1Q6TDU7 716 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 NBPF15Q8N660 670 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 RAD50Q92878 1312 aa8.71□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 SCN7AQ01118 1682 aa8.71□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 TDO2P48775 406 aa8.71□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 SLC51AQ86UW1 340 aa8.71□□□□□ -1.01
CCR6-202ENST00000349984 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CCDC189A1A4V9 331 aa8.71□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 MED4Q9NPJ6 270 aa8.71□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 A0A0G2JLW4 131 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 PROSER3Q2NL68 480 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TSC1Q92574 1164 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CACNA1SQ13698 1873 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 FAM177BA6PVY3 158 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 MYL6BP14649 208 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 MNS1Q8NEH6 495 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 LAMB1P07942 1786 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CHRNA5P30532 468 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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