RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000014640.8

Ankrd28-201, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd28, Length 6,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa26.83■■□□□ 1.89
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tceanc2Q8R2M0 207 aa26.83■■□□□ 1.89
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atp8b2P98199 1209 aa26.83■■□□□ 1.89
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Sun3Q5SS91 320 aa26.83■■□□□ 1.89
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm156Q58A37 223 aa26.83■■□□□ 1.89
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tmco5aQ9D9D5 303 aa26.83■■□□□ 1.89
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Trim27Q62158 513 aa26.83■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 SlmapQ3URD3 845 aa26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ankrd40Q5SUE8 363 aa26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Akap2O54931 893 aa26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nkx1-2P42580 305 aa26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fermt1P59113 677 aa26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 P4ha1Q60715 534 aa26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa26.82■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zkscan7E9PVW1 718 aa26.81■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa26.81■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Myl3P09542 204 aa26.81■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 GnaqP21279 359 aa26.81■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Krt15Q61414 452 aa26.81■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc93Q7TQK5 629 aa26.81■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Chmp6P0C0A3 200 aa26.8■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Naip5Q9R016 1403 aa26.8■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa26.8■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Palm3A2TJV2 734 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ift122Q6NWV3 1182 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rad50P70388 1312 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Smarcad1Q04692 1021 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Abtb2Q7TQI7 1024 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rdm1Q9CQK3 281 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 LarsQ8BMJ2 1178 aa26.79■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 ParnQ8VDG3 624 aa26.78■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa26.78■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Smco2Q9DA21 347 aa26.78■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hdhd2Q3UGR5 259 aa26.78■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 PrkcshO08795 521 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Iffo1Q8BXL9 562 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gtf2a1Q99PM3 378 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm42641I6L9G2 585 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 AtripQ8BMG1 785 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zmynd15Q8C0R7 736 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 MarcksP26645 309 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc122Q8BVN0 290 aa26.76■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mmel1Q9JLI3 765 aa26.76■■□□□ 1.88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nf2P46662 596 aa26.76■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Eme2Q56A04 373 aa26.76■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Skor1Q8BX46 964 aa26.76■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Smc1bQ920F6 1248 aa26.76■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gnat2P50149 354 aa26.76■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Exoc1Q8R3S6 894 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Usp25P57080 1055 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ift88Q61371 824 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 StambpQ9CQ26 424 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mcmdc2E9Q956 681 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cdca8Q8BHX3 289 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Usp37Q8C0R0 979 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tekt3Q6X6Z7 490 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Sbno1Q689Z5 1390 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 TrhQ62361 256 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Paxbp1P58501 919 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Astn2Q80Z10 1352 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Bbof1Q3V079 533 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pram1Q6BCL1 675 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Asic1Q6NXK8 526 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 ThemisQ8BGW0 636 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rtn1Q8K0T0 780 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Serpinc1P32261 465 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa26.74■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Msl1Q6PDM1 616 aa26.73■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cep135Q6P5D4 1140 aa26.73■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hook2Q7TMK6 716 aa26.73■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 BbxQ8VBW5 907 aa26.73■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 E9QMW4 1145 aa26.72■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gng11P61953 73 aa26.72■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa26.72■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Shtn1Q8K2Q9 631 aa26.72■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Asxl2Q8BZ32 1370 aa26.72■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa26.71■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ctage5Q8R311 779 aa26.71■■□□□ 1.87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NpcdF8VQB8 469 aa26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 110.3 ms