Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,56■■■■■ 4,08
Ccdc122Q8BVN0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Ccdc122Q8BVN0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Ccdc122Q8BVN0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Ccdc122Q8BVN0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Ccdc122Q8BVN0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Ccdc122Q8BVN0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,11■■■■□ 3,37
Ccdc122Q8BVN0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,69■■■■□ 3,3
Ccdc122Q8BVN0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ccdc122Q8BVN0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
Ccdc122Q8BVN0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ccdc122Q8BVN0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Ccdc122Q8BVN0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Ccdc122Q8BVN0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,84■■■■□ 3,17
Ccdc122Q8BVN0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Ccdc122Q8BVN0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Ccdc122Q8BVN0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Ccdc122Q8BVN0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Ccdc122Q8BVN0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Ccdc122Q8BVN0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Ccdc122Q8BVN0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Ccdc122Q8BVN0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Ccdc122Q8BVN0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ccdc122Q8BVN0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ccdc122Q8BVN0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ccdc122Q8BVN0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Ccdc122Q8BVN0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Ccdc122Q8BVN0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Ccdc122Q8BVN0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Ccdc122Q8BVN0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Ccdc122Q8BVN0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Ccdc122Q8BVN0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccdc122Q8BVN0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Ccdc122Q8BVN0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Ccdc122Q8BVN0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Ccdc122Q8BVN0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Ccdc122Q8BVN0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Ccdc122Q8BVN0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Ccdc122Q8BVN0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Ccdc122Q8BVN0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,17■■■□□ 2,9
Ccdc122Q8BVN0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Ccdc122Q8BVN0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Ccdc122Q8BVN0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Ccdc122Q8BVN0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Ccdc122Q8BVN0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Ccdc122Q8BVN0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Ccdc122Q8BVN0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Ccdc122Q8BVN0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Ccdc122Q8BVN0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Ccdc122Q8BVN0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Ccdc122Q8BVN0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Ccdc122Q8BVN0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Ccdc122Q8BVN0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Ccdc122Q8BVN0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Ccdc122Q8BVN0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Ccdc122Q8BVN0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Ccdc122Q8BVN0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,08■■■□□ 2,73
Ccdc122Q8BVN0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Ccdc122Q8BVN0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Ccdc122Q8BVN0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Ccdc122Q8BVN0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Ccdc122Q8BVN0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Ccdc122Q8BVN0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Ccdc122Q8BVN0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Ccdc122Q8BVN0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Ccdc122Q8BVN0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Ccdc122Q8BVN0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Ccdc122Q8BVN0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Ccdc122Q8BVN0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,79■■■□□ 2,68
Ccdc122Q8BVN0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Ccdc122Q8BVN0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Ccdc122Q8BVN0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Ccdc122Q8BVN0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Ccdc122Q8BVN0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Ccdc122Q8BVN0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Ccdc122Q8BVN0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Ccdc122Q8BVN0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Ccdc122Q8BVN0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Ccdc122Q8BVN0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Ccdc122Q8BVN0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Ccdc122Q8BVN0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Ccdc122Q8BVN0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Ccdc122Q8BVN0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Ccdc122Q8BVN0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Ccdc122Q8BVN0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Ccdc122Q8BVN0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Ccdc122Q8BVN0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Ccdc122Q8BVN0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Ccdc122Q8BVN0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Ccdc122Q8BVN0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Ccdc122Q8BVN0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Ccdc122Q8BVN0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Ccdc122Q8BVN0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Ccdc122Q8BVN0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Ccdc122Q8BVN0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Ccdc122Q8BVN0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Ccdc122Q8BVN0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Ccdc122Q8BVN0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Ccdc122Q8BVN0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Ccdc122Q8BVN0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms