Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,48■■■■□ 3,43
Tmco5aQ9D9D5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Tmco5aQ9D9D5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Tmco5aQ9D9D5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Tmco5aQ9D9D5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Tmco5aQ9D9D5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Tmco5aQ9D9D5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Tmco5aQ9D9D5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Tmco5aQ9D9D5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Tmco5aQ9D9D5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Tmco5aQ9D9D5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,01■■■□□ 2,71
Tmco5aQ9D9D5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Tmco5aQ9D9D5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Tmco5aQ9D9D5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Tmco5aQ9D9D5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Tmco5aQ9D9D5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Tmco5aQ9D9D5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Tmco5aQ9D9D5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Tmco5aQ9D9D5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Tmco5aQ9D9D5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Tmco5aQ9D9D5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Tmco5aQ9D9D5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Tmco5aQ9D9D5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Tmco5aQ9D9D5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Tmco5aQ9D9D5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Tmco5aQ9D9D5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Tmco5aQ9D9D5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Tmco5aQ9D9D5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Tmco5aQ9D9D5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Tmco5aQ9D9D5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Tmco5aQ9D9D5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Tmco5aQ9D9D5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Tmco5aQ9D9D5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Tmco5aQ9D9D5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Tmco5aQ9D9D5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Tmco5aQ9D9D5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Tmco5aQ9D9D5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Tmco5aQ9D9D5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Tmco5aQ9D9D5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Tmco5aQ9D9D5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Tmco5aQ9D9D5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Tmco5aQ9D9D5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Tmco5aQ9D9D5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Tmco5aQ9D9D5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Tmco5aQ9D9D5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Tmco5aQ9D9D5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Tmco5aQ9D9D5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Tmco5aQ9D9D5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Tmco5aQ9D9D5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Tmco5aQ9D9D5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Tmco5aQ9D9D5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Tmco5aQ9D9D5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Tmco5aQ9D9D5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tmco5aQ9D9D5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tmco5aQ9D9D5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tmco5aQ9D9D5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tmco5aQ9D9D5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Tmco5aQ9D9D5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tmco5aQ9D9D5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Tmco5aQ9D9D5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Tmco5aQ9D9D5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Tmco5aQ9D9D5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Tmco5aQ9D9D5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Tmco5aQ9D9D5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Tmco5aQ9D9D5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Tmco5aQ9D9D5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tmco5aQ9D9D5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tmco5aQ9D9D5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tmco5aQ9D9D5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tmco5aQ9D9D5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tmco5aQ9D9D5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Tmco5aQ9D9D5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Tmco5aQ9D9D5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Tmco5aQ9D9D5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tmco5aQ9D9D5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tmco5aQ9D9D5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tmco5aQ9D9D5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Tmco5aQ9D9D5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tmco5aQ9D9D5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tmco5aQ9D9D5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tmco5aQ9D9D5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tmco5aQ9D9D5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tmco5aQ9D9D5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tmco5aQ9D9D5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tmco5aQ9D9D5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Tmco5aQ9D9D5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tmco5aQ9D9D5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tmco5aQ9D9D5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Tmco5aQ9D9D5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tmco5aQ9D9D5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tmco5aQ9D9D5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tmco5aQ9D9D5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tmco5aQ9D9D5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tmco5aQ9D9D5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tmco5aQ9D9D5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
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