Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
Usp37Q8C0R0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Usp37Q8C0R0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Usp37Q8C0R0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Usp37Q8C0R0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Usp37Q8C0R0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Usp37Q8C0R0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Usp37Q8C0R0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Usp37Q8C0R0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Usp37Q8C0R0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Usp37Q8C0R0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Usp37Q8C0R0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Usp37Q8C0R0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Usp37Q8C0R0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Usp37Q8C0R0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Usp37Q8C0R0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp37Q8C0R0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Usp37Q8C0R0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Usp37Q8C0R0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Usp37Q8C0R0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Usp37Q8C0R0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Usp37Q8C0R0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Usp37Q8C0R0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp37Q8C0R0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp37Q8C0R0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Usp37Q8C0R0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp37Q8C0R0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Usp37Q8C0R0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Usp37Q8C0R0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Usp37Q8C0R0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Usp37Q8C0R0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Usp37Q8C0R0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Usp37Q8C0R0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp37Q8C0R0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Usp37Q8C0R0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp37Q8C0R0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Usp37Q8C0R0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp37Q8C0R0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Usp37Q8C0R0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp37Q8C0R0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp37Q8C0R0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp37Q8C0R0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp37Q8C0R0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp37Q8C0R0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp37Q8C0R0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp37Q8C0R0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp37Q8C0R0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Usp37Q8C0R0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp37Q8C0R0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp37Q8C0R0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp37Q8C0R0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp37Q8C0R0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp37Q8C0R0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp37Q8C0R0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp37Q8C0R0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Usp37Q8C0R0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Usp37Q8C0R0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp37Q8C0R0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Usp37Q8C0R0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Usp37Q8C0R0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Usp37Q8C0R0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Usp37Q8C0R0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Usp37Q8C0R0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp37Q8C0R0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Usp37Q8C0R0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Usp37Q8C0R0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Usp37Q8C0R0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Usp37Q8C0R0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Usp37Q8C0R0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Usp37Q8C0R0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Usp37Q8C0R0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Usp37Q8C0R0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Usp37Q8C0R0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Usp37Q8C0R0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp37Q8C0R0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Usp37Q8C0R0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Usp37Q8C0R0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Usp37Q8C0R0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp37Q8C0R0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp37Q8C0R0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp37Q8C0R0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp37Q8C0R0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp37Q8C0R0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Usp37Q8C0R0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp37Q8C0R0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Usp37Q8C0R0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Usp37Q8C0R0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Usp37Q8C0R0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Usp37Q8C0R0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Usp37Q8C0R0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Usp37Q8C0R0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp37Q8C0R0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp37Q8C0R0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp37Q8C0R0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp37Q8C0R0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Usp37Q8C0R0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp37Q8C0R0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp37Q8C0R0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp37Q8C0R0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp37Q8C0R0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms