Protein–RNA interactions for Protein: Q61414

Krt15, Keratin, type I cytoskeletal 15, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt15Q61414 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,77■■■■□ 3,8
Krt15Q61414 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Krt15Q61414 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Krt15Q61414 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Krt15Q61414 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Krt15Q61414 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Krt15Q61414 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Krt15Q61414 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Krt15Q61414 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Krt15Q61414 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
Krt15Q61414 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Krt15Q61414 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Krt15Q61414 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Krt15Q61414 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Krt15Q61414 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,25■■■□□ 2,91
Krt15Q61414 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Krt15Q61414 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Krt15Q61414 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Krt15Q61414 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Krt15Q61414 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Krt15Q61414 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Krt15Q61414 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Krt15Q61414 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Krt15Q61414 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Krt15Q61414 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Krt15Q61414 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Krt15Q61414 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Krt15Q61414 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Krt15Q61414 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Krt15Q61414 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Krt15Q61414 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Krt15Q61414 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Krt15Q61414 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Krt15Q61414 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Krt15Q61414 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Krt15Q61414 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Krt15Q61414 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Krt15Q61414 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Krt15Q61414 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Krt15Q61414 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Krt15Q61414 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Krt15Q61414 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Krt15Q61414 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Krt15Q61414 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Krt15Q61414 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Krt15Q61414 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Krt15Q61414 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Krt15Q61414 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Krt15Q61414 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Krt15Q61414 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Krt15Q61414 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Krt15Q61414 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Krt15Q61414 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Krt15Q61414 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
Krt15Q61414 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Krt15Q61414 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Krt15Q61414 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Krt15Q61414 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Krt15Q61414 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Krt15Q61414 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Krt15Q61414 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Krt15Q61414 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,7■■■□□ 2,5
Krt15Q61414 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Krt15Q61414 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Krt15Q61414 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Krt15Q61414 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Krt15Q61414 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Krt15Q61414 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Krt15Q61414 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Krt15Q61414 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Krt15Q61414 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
Krt15Q61414 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Krt15Q61414 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Krt15Q61414 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
Krt15Q61414 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Krt15Q61414 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Krt15Q61414 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Krt15Q61414 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Krt15Q61414 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Krt15Q61414 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Krt15Q61414 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Krt15Q61414 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Krt15Q61414 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Krt15Q61414 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Krt15Q61414 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Krt15Q61414 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Krt15Q61414 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Krt15Q61414 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Krt15Q61414 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Krt15Q61414 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Krt15Q61414 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Krt15Q61414 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Krt15Q61414 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Krt15Q61414 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Krt15Q61414 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Krt15Q61414 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Krt15Q61414 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Krt15Q61414 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Krt15Q61414 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Krt15Q61414 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms