Protein–RNA interactions for Protein: Q61414

Krt15, Keratin, type I cytoskeletal 15, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt15Q61414 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Krt15Q61414 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Krt15Q61414 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Krt15Q61414 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Krt15Q61414 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Krt15Q61414 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Krt15Q61414 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Krt15Q61414 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Krt15Q61414 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Krt15Q61414 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Krt15Q61414 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Krt15Q61414 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Krt15Q61414 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Krt15Q61414 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Krt15Q61414 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Krt15Q61414 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Krt15Q61414 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Krt15Q61414 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Krt15Q61414 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Krt15Q61414 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Krt15Q61414 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Krt15Q61414 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Krt15Q61414 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Krt15Q61414 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Krt15Q61414 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Krt15Q61414 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Krt15Q61414 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Krt15Q61414 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Krt15Q61414 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Krt15Q61414 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Krt15Q61414 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Krt15Q61414 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Krt15Q61414 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Krt15Q61414 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Krt15Q61414 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Krt15Q61414 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Krt15Q61414 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Krt15Q61414 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Krt15Q61414 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Krt15Q61414 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Krt15Q61414 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Krt15Q61414 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Krt15Q61414 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Krt15Q61414 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Krt15Q61414 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Krt15Q61414 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Krt15Q61414 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Krt15Q61414 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Krt15Q61414 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Krt15Q61414 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Krt15Q61414 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Krt15Q61414 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Krt15Q61414 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Krt15Q61414 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Krt15Q61414 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Krt15Q61414 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Krt15Q61414 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Krt15Q61414 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Krt15Q61414 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Krt15Q61414 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Krt15Q61414 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Krt15Q61414 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Krt15Q61414 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Krt15Q61414 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Krt15Q61414 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Krt15Q61414 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Krt15Q61414 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Krt15Q61414 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Krt15Q61414 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Krt15Q61414 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Krt15Q61414 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Krt15Q61414 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Krt15Q61414 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Krt15Q61414 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Krt15Q61414 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Krt15Q61414 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Krt15Q61414 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Krt15Q61414 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Krt15Q61414 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Krt15Q61414 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Krt15Q61414 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Krt15Q61414 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Krt15Q61414 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Krt15Q61414 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Krt15Q61414 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Krt15Q61414 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Krt15Q61414 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Krt15Q61414 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Krt15Q61414 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Krt15Q61414 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Krt15Q61414 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Krt15Q61414 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Krt15Q61414 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Krt15Q61414 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Krt15Q61414 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Krt15Q61414 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Krt15Q61414 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Krt15Q61414 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Krt15Q61414 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Krt15Q61414 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms