RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 HemgnQ9ERZ0 503 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4930469K13RikA0A286YDB2 92 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mn1D3YWE6 1297 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm7971J3QMM8 481 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 DdostO54734 441 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 P01804 111 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gal3st4Q3V1B8 480 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q5SPV6 233 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lpcat4Q6NVG1 524 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tlr11Q6R5P0 926 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1087Q7TR63 313 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Elmod2Q8BGF6 293 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Arrb2Q91YI4 410 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4933421I07RikQ9D420 214 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Il36aQ9JLA2 160 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc7a5Q9Z127 512 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp738B8JJX8 793 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm14139F6ZS36 494 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fbxw25F7C9P2 466 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r34G3XA52 309 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sirpb1cK7N6K7 397 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clcn7O70496 803 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pex2P55098 305 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 BidP70444 195 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 OgnQ62000 298 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 St6gal1Q64685 403 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Memo1Q91VH6 297 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ranbp3Q9CT10 491 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nup37Q9CWU9 326 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Neurl2Q9D0S4 285 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tex47Q9D5W8 253 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pfn3Q9DAD6 137 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vps29Q9QZ88 182 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ClcnkbQ9WUB6 687 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ClcnkaQ9WUB7 687 aa6.6□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trip11E9Q512 1976 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sult2a3D3Z1W5 285 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AcadvlP50544 656 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Thbs2Q03350 1172 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rasl12Q08AT1 266 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Obox3Q3UT54 335 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Taar7fQ5QD08 358 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Taar7bQ5QD11 358 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tgoln1Q62313 353 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 BC061212Q6P8K3 481 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Chst10Q6PGK7 356 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tas2r106Q7M724 308 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dlgap5Q8K4R9 808 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1453Q8VFX0 307 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc27a4Q91VE0 643 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 NpvfQ9ESQ8 188 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CtsjQ9R014 334 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp236S4R299 1847 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trbc1A0A0A6YWV4 173 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zmynd12A2BGJ5 363 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4930467E23RikD3Z1P8 350 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm15319E9Q637 350 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 P01852 173 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TpbpaP13438 124 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 B4galt1P15535 399 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Phxr1P15973 60 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Id2P41136 134 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scn1bP97952 218 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 UqcrhP99028 89 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Foxred1Q3TQB2 487 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cln5Q3UMW8 341 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ankub1Q3UUE9 192 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd47Q61735 303 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Syt16Q7TN83 639 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm21119Q8C646 350 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dnajc22Q8CHS2 339 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdc42ep2Q8JZX9 214 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 EbplQ9D0P0 206 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Srxn1Q9D975 136 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tspan4Q9DCK3 238 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r56Q9EPS9 310 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Klhl15A2AAX3 604 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 1700023F06RikA2AB62 382 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 P06336 421 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nr4a1P12813 601 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ErfP70459 551 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Itgb8Q0VBD0 767 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp935Q14DI0 353 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Eri1Q7TMF2 345 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mfn2Q80U63 757 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fads6Q80UG1 342 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Creb3l2Q8BH52 521 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dusp28Q8BTR5 163 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SowahbQ8BZW2 760 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fam118bQ8C569 351 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Defb10Q8R2I8 73 aa6.59□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr770Q8VGC2 311 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.5 ms