Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Vps29Q9QZ88 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Vps29Q9QZ88 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Vps29Q9QZ88 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Vps29Q9QZ88 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Vps29Q9QZ88 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Vps29Q9QZ88 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Vps29Q9QZ88 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Vps29Q9QZ88 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vps29Q9QZ88 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Vps29Q9QZ88 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Vps29Q9QZ88 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Vps29Q9QZ88 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Vps29Q9QZ88 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps29Q9QZ88 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vps29Q9QZ88 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps29Q9QZ88 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vps29Q9QZ88 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Vps29Q9QZ88 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vps29Q9QZ88 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps29Q9QZ88 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps29Q9QZ88 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps29Q9QZ88 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps29Q9QZ88 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps29Q9QZ88 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps29Q9QZ88 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps29Q9QZ88 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps29Q9QZ88 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps29Q9QZ88 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps29Q9QZ88 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps29Q9QZ88 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps29Q9QZ88 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps29Q9QZ88 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps29Q9QZ88 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps29Q9QZ88 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vps29Q9QZ88 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps29Q9QZ88 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps29Q9QZ88 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps29Q9QZ88 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps29Q9QZ88 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps29Q9QZ88 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps29Q9QZ88 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps29Q9QZ88 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps29Q9QZ88 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps29Q9QZ88 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps29Q9QZ88 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps29Q9QZ88 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps29Q9QZ88 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps29Q9QZ88 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps29Q9QZ88 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps29Q9QZ88 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps29Q9QZ88 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps29Q9QZ88 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps29Q9QZ88 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps29Q9QZ88 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Vps29Q9QZ88 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps29Q9QZ88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps29Q9QZ88 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps29Q9QZ88 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps29Q9QZ88 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps29Q9QZ88 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps29Q9QZ88 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps29Q9QZ88 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps29Q9QZ88 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps29Q9QZ88 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps29Q9QZ88 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps29Q9QZ88 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps29Q9QZ88 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps29Q9QZ88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps29Q9QZ88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps29Q9QZ88 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps29Q9QZ88 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps29Q9QZ88 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps29Q9QZ88 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps29Q9QZ88 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps29Q9QZ88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps29Q9QZ88 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps29Q9QZ88 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps29Q9QZ88 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps29Q9QZ88 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps29Q9QZ88 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps29Q9QZ88 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps29Q9QZ88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps29Q9QZ88 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps29Q9QZ88 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps29Q9QZ88 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps29Q9QZ88 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps29Q9QZ88 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps29Q9QZ88 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps29Q9QZ88 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps29Q9QZ88 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps29Q9QZ88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps29Q9QZ88 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps29Q9QZ88 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps29Q9QZ88 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps29Q9QZ88 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps29Q9QZ88 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps29Q9QZ88 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps29Q9QZ88 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps29Q9QZ88 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms