Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Pfn3Q9DAD6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pfn3Q9DAD6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pfn3Q9DAD6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pfn3Q9DAD6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pfn3Q9DAD6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Pfn3Q9DAD6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Pfn3Q9DAD6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Pfn3Q9DAD6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Pfn3Q9DAD6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pfn3Q9DAD6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pfn3Q9DAD6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pfn3Q9DAD6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Pfn3Q9DAD6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Pfn3Q9DAD6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Pfn3Q9DAD6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pfn3Q9DAD6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pfn3Q9DAD6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pfn3Q9DAD6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pfn3Q9DAD6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pfn3Q9DAD6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pfn3Q9DAD6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pfn3Q9DAD6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pfn3Q9DAD6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pfn3Q9DAD6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pfn3Q9DAD6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pfn3Q9DAD6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pfn3Q9DAD6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pfn3Q9DAD6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pfn3Q9DAD6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Pfn3Q9DAD6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pfn3Q9DAD6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pfn3Q9DAD6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pfn3Q9DAD6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pfn3Q9DAD6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pfn3Q9DAD6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pfn3Q9DAD6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pfn3Q9DAD6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pfn3Q9DAD6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pfn3Q9DAD6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pfn3Q9DAD6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pfn3Q9DAD6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pfn3Q9DAD6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pfn3Q9DAD6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pfn3Q9DAD6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pfn3Q9DAD6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pfn3Q9DAD6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pfn3Q9DAD6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pfn3Q9DAD6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pfn3Q9DAD6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pfn3Q9DAD6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pfn3Q9DAD6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pfn3Q9DAD6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pfn3Q9DAD6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pfn3Q9DAD6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pfn3Q9DAD6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pfn3Q9DAD6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pfn3Q9DAD6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pfn3Q9DAD6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pfn3Q9DAD6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pfn3Q9DAD6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pfn3Q9DAD6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pfn3Q9DAD6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pfn3Q9DAD6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pfn3Q9DAD6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pfn3Q9DAD6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pfn3Q9DAD6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pfn3Q9DAD6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pfn3Q9DAD6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pfn3Q9DAD6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pfn3Q9DAD6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pfn3Q9DAD6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pfn3Q9DAD6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pfn3Q9DAD6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pfn3Q9DAD6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pfn3Q9DAD6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pfn3Q9DAD6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pfn3Q9DAD6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pfn3Q9DAD6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pfn3Q9DAD6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pfn3Q9DAD6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pfn3Q9DAD6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pfn3Q9DAD6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pfn3Q9DAD6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pfn3Q9DAD6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pfn3Q9DAD6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pfn3Q9DAD6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pfn3Q9DAD6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pfn3Q9DAD6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pfn3Q9DAD6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pfn3Q9DAD6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pfn3Q9DAD6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pfn3Q9DAD6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pfn3Q9DAD6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pfn3Q9DAD6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pfn3Q9DAD6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pfn3Q9DAD6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pfn3Q9DAD6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pfn3Q9DAD6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pfn3Q9DAD6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms