Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
P01852 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
P01852 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
P01852 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
P01852 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
P01852 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
P01852 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
P01852 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
P01852 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
P01852 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P01852 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
P01852 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
P01852 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
P01852 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
P01852 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
P01852 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
P01852 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
P01852 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
P01852 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
P01852 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
P01852 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
P01852 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
P01852 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
P01852 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P01852 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P01852 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P01852 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
P01852 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P01852 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
P01852 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P01852 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
P01852 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P01852 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
P01852 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
P01852 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
P01852 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
P01852 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
P01852 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P01852 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
P01852 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P01852 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
P01852 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
P01852 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
P01852 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
P01852 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P01852 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P01852 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P01852 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P01852 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P01852 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
P01852 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
P01852 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
P01852 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
P01852 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P01852 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
P01852 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P01852 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
P01852 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01852 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01852 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P01852 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01852 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
P01852 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P01852 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
P01852 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01852 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01852 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
P01852 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P01852 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P01852 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P01852 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01852 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01852 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01852 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01852 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01852 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P01852 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
P01852 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
P01852 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01852 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01852 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01852 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
P01852 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01852 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P01852 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
P01852 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
P01852 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01852 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
P01852 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
P01852 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
P01852 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P01852 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
P01852 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P01852 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
P01852 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
P01852 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P01852 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P01852 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P01852 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P01852 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms