Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ClcnkbQ9WUB6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ClcnkbQ9WUB6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ClcnkbQ9WUB6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ClcnkbQ9WUB6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ClcnkbQ9WUB6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ClcnkbQ9WUB6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ClcnkbQ9WUB6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ClcnkbQ9WUB6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ClcnkbQ9WUB6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ClcnkbQ9WUB6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ClcnkbQ9WUB6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ClcnkbQ9WUB6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ClcnkbQ9WUB6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ClcnkbQ9WUB6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ClcnkbQ9WUB6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ClcnkbQ9WUB6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ClcnkbQ9WUB6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ClcnkbQ9WUB6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ClcnkbQ9WUB6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ClcnkbQ9WUB6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ClcnkbQ9WUB6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ClcnkbQ9WUB6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ClcnkbQ9WUB6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ClcnkbQ9WUB6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ClcnkbQ9WUB6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ClcnkbQ9WUB6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ClcnkbQ9WUB6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ClcnkbQ9WUB6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ClcnkbQ9WUB6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ClcnkbQ9WUB6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ClcnkbQ9WUB6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ClcnkbQ9WUB6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ClcnkbQ9WUB6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ClcnkbQ9WUB6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ClcnkbQ9WUB6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ClcnkbQ9WUB6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ClcnkbQ9WUB6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ClcnkbQ9WUB6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ClcnkbQ9WUB6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ClcnkbQ9WUB6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ClcnkbQ9WUB6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ClcnkbQ9WUB6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ClcnkbQ9WUB6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ClcnkbQ9WUB6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ClcnkbQ9WUB6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ClcnkbQ9WUB6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ClcnkbQ9WUB6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ClcnkbQ9WUB6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ClcnkbQ9WUB6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ClcnkbQ9WUB6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ClcnkbQ9WUB6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ClcnkbQ9WUB6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ClcnkbQ9WUB6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ClcnkbQ9WUB6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ClcnkbQ9WUB6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ClcnkbQ9WUB6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ClcnkbQ9WUB6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ClcnkbQ9WUB6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ClcnkbQ9WUB6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ClcnkbQ9WUB6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ClcnkbQ9WUB6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ClcnkbQ9WUB6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ClcnkbQ9WUB6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ClcnkbQ9WUB6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ClcnkbQ9WUB6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ClcnkbQ9WUB6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ClcnkbQ9WUB6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ClcnkbQ9WUB6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ClcnkbQ9WUB6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ClcnkbQ9WUB6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ClcnkbQ9WUB6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ClcnkbQ9WUB6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ClcnkbQ9WUB6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ClcnkbQ9WUB6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ClcnkbQ9WUB6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ClcnkbQ9WUB6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ClcnkbQ9WUB6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ClcnkbQ9WUB6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ClcnkbQ9WUB6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClcnkbQ9WUB6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ClcnkbQ9WUB6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClcnkbQ9WUB6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ClcnkbQ9WUB6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ClcnkbQ9WUB6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClcnkbQ9WUB6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ClcnkbQ9WUB6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ClcnkbQ9WUB6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ClcnkbQ9WUB6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ClcnkbQ9WUB6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ClcnkbQ9WUB6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClcnkbQ9WUB6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClcnkbQ9WUB6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClcnkbQ9WUB6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ClcnkbQ9WUB6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ClcnkbQ9WUB6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ClcnkbQ9WUB6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ClcnkbQ9WUB6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ClcnkbQ9WUB6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ClcnkbQ9WUB6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 597 ms