Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Cln5Q3UMW8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cln5Q3UMW8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cln5Q3UMW8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cln5Q3UMW8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cln5Q3UMW8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cln5Q3UMW8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cln5Q3UMW8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cln5Q3UMW8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cln5Q3UMW8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cln5Q3UMW8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cln5Q3UMW8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cln5Q3UMW8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cln5Q3UMW8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cln5Q3UMW8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cln5Q3UMW8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cln5Q3UMW8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cln5Q3UMW8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cln5Q3UMW8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cln5Q3UMW8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cln5Q3UMW8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cln5Q3UMW8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cln5Q3UMW8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cln5Q3UMW8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cln5Q3UMW8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cln5Q3UMW8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cln5Q3UMW8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cln5Q3UMW8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cln5Q3UMW8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cln5Q3UMW8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cln5Q3UMW8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cln5Q3UMW8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cln5Q3UMW8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cln5Q3UMW8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cln5Q3UMW8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cln5Q3UMW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cln5Q3UMW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cln5Q3UMW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cln5Q3UMW8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cln5Q3UMW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cln5Q3UMW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cln5Q3UMW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cln5Q3UMW8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cln5Q3UMW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cln5Q3UMW8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cln5Q3UMW8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cln5Q3UMW8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cln5Q3UMW8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cln5Q3UMW8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cln5Q3UMW8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cln5Q3UMW8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cln5Q3UMW8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cln5Q3UMW8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cln5Q3UMW8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cln5Q3UMW8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cln5Q3UMW8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cln5Q3UMW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cln5Q3UMW8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cln5Q3UMW8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cln5Q3UMW8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cln5Q3UMW8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cln5Q3UMW8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cln5Q3UMW8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cln5Q3UMW8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cln5Q3UMW8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cln5Q3UMW8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln5Q3UMW8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln5Q3UMW8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cln5Q3UMW8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cln5Q3UMW8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cln5Q3UMW8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cln5Q3UMW8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cln5Q3UMW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cln5Q3UMW8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cln5Q3UMW8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cln5Q3UMW8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cln5Q3UMW8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cln5Q3UMW8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cln5Q3UMW8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cln5Q3UMW8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cln5Q3UMW8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cln5Q3UMW8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cln5Q3UMW8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cln5Q3UMW8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cln5Q3UMW8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cln5Q3UMW8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cln5Q3UMW8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cln5Q3UMW8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cln5Q3UMW8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cln5Q3UMW8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cln5Q3UMW8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cln5Q3UMW8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cln5Q3UMW8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cln5Q3UMW8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cln5Q3UMW8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cln5Q3UMW8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln5Q3UMW8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cln5Q3UMW8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cln5Q3UMW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cln5Q3UMW8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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