Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Thbs2Q03350 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Thbs2Q03350 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Thbs2Q03350 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Thbs2Q03350 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Thbs2Q03350 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Thbs2Q03350 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Thbs2Q03350 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Thbs2Q03350 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Thbs2Q03350 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thbs2Q03350 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Thbs2Q03350 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Thbs2Q03350 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Thbs2Q03350 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Thbs2Q03350 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Thbs2Q03350 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Thbs2Q03350 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Thbs2Q03350 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thbs2Q03350 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Thbs2Q03350 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Thbs2Q03350 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Thbs2Q03350 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Thbs2Q03350 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thbs2Q03350 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Thbs2Q03350 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Thbs2Q03350 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thbs2Q03350 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Thbs2Q03350 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Thbs2Q03350 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thbs2Q03350 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thbs2Q03350 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Thbs2Q03350 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Thbs2Q03350 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Thbs2Q03350 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thbs2Q03350 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Thbs2Q03350 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Thbs2Q03350 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Thbs2Q03350 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thbs2Q03350 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Thbs2Q03350 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thbs2Q03350 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thbs2Q03350 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thbs2Q03350 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thbs2Q03350 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Thbs2Q03350 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Thbs2Q03350 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thbs2Q03350 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Thbs2Q03350 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thbs2Q03350 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thbs2Q03350 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Thbs2Q03350 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Thbs2Q03350 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Thbs2Q03350 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Thbs2Q03350 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Thbs2Q03350 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Thbs2Q03350 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Thbs2Q03350 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Thbs2Q03350 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Thbs2Q03350 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Thbs2Q03350 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thbs2Q03350 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thbs2Q03350 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Thbs2Q03350 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thbs2Q03350 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thbs2Q03350 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thbs2Q03350 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thbs2Q03350 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thbs2Q03350 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thbs2Q03350 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thbs2Q03350 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thbs2Q03350 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Thbs2Q03350 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Thbs2Q03350 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Thbs2Q03350 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Thbs2Q03350 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Thbs2Q03350 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thbs2Q03350 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Thbs2Q03350 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thbs2Q03350 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thbs2Q03350 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Thbs2Q03350 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Thbs2Q03350 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Thbs2Q03350 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Thbs2Q03350 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thbs2Q03350 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thbs2Q03350 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thbs2Q03350 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thbs2Q03350 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thbs2Q03350 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thbs2Q03350 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thbs2Q03350 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thbs2Q03350 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thbs2Q03350 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thbs2Q03350 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thbs2Q03350 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thbs2Q03350 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thbs2Q03350 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thbs2Q03350 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thbs2Q03350 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thbs2Q03350 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms