Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Scn1bP97952 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Scn1bP97952 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Scn1bP97952 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Scn1bP97952 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Scn1bP97952 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Scn1bP97952 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scn1bP97952 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scn1bP97952 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn1bP97952 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn1bP97952 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn1bP97952 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn1bP97952 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn1bP97952 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scn1bP97952 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn1bP97952 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn1bP97952 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn1bP97952 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn1bP97952 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn1bP97952 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn1bP97952 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn1bP97952 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn1bP97952 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn1bP97952 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Scn1bP97952 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn1bP97952 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn1bP97952 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn1bP97952 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn1bP97952 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn1bP97952 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn1bP97952 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn1bP97952 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scn1bP97952 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn1bP97952 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn1bP97952 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn1bP97952 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Scn1bP97952 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn1bP97952 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn1bP97952 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn1bP97952 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn1bP97952 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn1bP97952 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn1bP97952 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn1bP97952 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn1bP97952 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn1bP97952 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn1bP97952 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn1bP97952 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scn1bP97952 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Scn1bP97952 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scn1bP97952 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn1bP97952 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn1bP97952 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn1bP97952 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn1bP97952 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn1bP97952 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scn1bP97952 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn1bP97952 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn1bP97952 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn1bP97952 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn1bP97952 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn1bP97952 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn1bP97952 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn1bP97952 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scn1bP97952 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn1bP97952 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn1bP97952 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn1bP97952 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn1bP97952 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn1bP97952 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn1bP97952 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn1bP97952 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn1bP97952 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn1bP97952 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn1bP97952 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn1bP97952 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn1bP97952 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn1bP97952 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn1bP97952 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn1bP97952 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn1bP97952 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn1bP97952 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn1bP97952 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn1bP97952 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn1bP97952 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn1bP97952 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn1bP97952 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn1bP97952 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn1bP97952 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn1bP97952 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn1bP97952 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn1bP97952 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn1bP97952 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn1bP97952 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn1bP97952 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn1bP97952 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn1bP97952 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn1bP97952 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn1bP97952 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn1bP97952 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms