Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Vmn1r56Q9EPS9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Vmn1r56Q9EPS9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Vmn1r56Q9EPS9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vmn1r56Q9EPS9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vmn1r56Q9EPS9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vmn1r56Q9EPS9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Vmn1r56Q9EPS9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Vmn1r56Q9EPS9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vmn1r56Q9EPS9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Vmn1r56Q9EPS9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Vmn1r56Q9EPS9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vmn1r56Q9EPS9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vmn1r56Q9EPS9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vmn1r56Q9EPS9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vmn1r56Q9EPS9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Vmn1r56Q9EPS9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn1r56Q9EPS9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn1r56Q9EPS9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vmn1r56Q9EPS9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn1r56Q9EPS9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Vmn1r56Q9EPS9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r56Q9EPS9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r56Q9EPS9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vmn1r56Q9EPS9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vmn1r56Q9EPS9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vmn1r56Q9EPS9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r56Q9EPS9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vmn1r56Q9EPS9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn1r56Q9EPS9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn1r56Q9EPS9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vmn1r56Q9EPS9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn1r56Q9EPS9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r56Q9EPS9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vmn1r56Q9EPS9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vmn1r56Q9EPS9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vmn1r56Q9EPS9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vmn1r56Q9EPS9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r56Q9EPS9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vmn1r56Q9EPS9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vmn1r56Q9EPS9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r56Q9EPS9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn1r56Q9EPS9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vmn1r56Q9EPS9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r56Q9EPS9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn1r56Q9EPS9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r56Q9EPS9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r56Q9EPS9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r56Q9EPS9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r56Q9EPS9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r56Q9EPS9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r56Q9EPS9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn1r56Q9EPS9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r56Q9EPS9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn1r56Q9EPS9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r56Q9EPS9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r56Q9EPS9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r56Q9EPS9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r56Q9EPS9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r56Q9EPS9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r56Q9EPS9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r56Q9EPS9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r56Q9EPS9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r56Q9EPS9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r56Q9EPS9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r56Q9EPS9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r56Q9EPS9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r56Q9EPS9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r56Q9EPS9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r56Q9EPS9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r56Q9EPS9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r56Q9EPS9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r56Q9EPS9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r56Q9EPS9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r56Q9EPS9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn1r56Q9EPS9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r56Q9EPS9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r56Q9EPS9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r56Q9EPS9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r56Q9EPS9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r56Q9EPS9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r56Q9EPS9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r56Q9EPS9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r56Q9EPS9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn1r56Q9EPS9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r56Q9EPS9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r56Q9EPS9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r56Q9EPS9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r56Q9EPS9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r56Q9EPS9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r56Q9EPS9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r56Q9EPS9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r56Q9EPS9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms