Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB7

Clcnka, Chloride channel protein ClC-Ka, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkaQ9WUB7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
ClcnkaQ9WUB7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ClcnkaQ9WUB7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ClcnkaQ9WUB7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ClcnkaQ9WUB7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ClcnkaQ9WUB7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ClcnkaQ9WUB7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ClcnkaQ9WUB7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ClcnkaQ9WUB7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ClcnkaQ9WUB7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ClcnkaQ9WUB7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ClcnkaQ9WUB7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ClcnkaQ9WUB7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ClcnkaQ9WUB7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ClcnkaQ9WUB7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ClcnkaQ9WUB7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ClcnkaQ9WUB7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ClcnkaQ9WUB7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ClcnkaQ9WUB7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ClcnkaQ9WUB7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ClcnkaQ9WUB7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ClcnkaQ9WUB7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ClcnkaQ9WUB7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ClcnkaQ9WUB7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClcnkaQ9WUB7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ClcnkaQ9WUB7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ClcnkaQ9WUB7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClcnkaQ9WUB7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ClcnkaQ9WUB7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClcnkaQ9WUB7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ClcnkaQ9WUB7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ClcnkaQ9WUB7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ClcnkaQ9WUB7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ClcnkaQ9WUB7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ClcnkaQ9WUB7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ClcnkaQ9WUB7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ClcnkaQ9WUB7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ClcnkaQ9WUB7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClcnkaQ9WUB7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ClcnkaQ9WUB7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClcnkaQ9WUB7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ClcnkaQ9WUB7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ClcnkaQ9WUB7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ClcnkaQ9WUB7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ClcnkaQ9WUB7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ClcnkaQ9WUB7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ClcnkaQ9WUB7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ClcnkaQ9WUB7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ClcnkaQ9WUB7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ClcnkaQ9WUB7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ClcnkaQ9WUB7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ClcnkaQ9WUB7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ClcnkaQ9WUB7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ClcnkaQ9WUB7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ClcnkaQ9WUB7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ClcnkaQ9WUB7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ClcnkaQ9WUB7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ClcnkaQ9WUB7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ClcnkaQ9WUB7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ClcnkaQ9WUB7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ClcnkaQ9WUB7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClcnkaQ9WUB7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ClcnkaQ9WUB7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ClcnkaQ9WUB7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ClcnkaQ9WUB7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ClcnkaQ9WUB7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ClcnkaQ9WUB7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ClcnkaQ9WUB7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ClcnkaQ9WUB7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ClcnkaQ9WUB7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ClcnkaQ9WUB7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ClcnkaQ9WUB7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ClcnkaQ9WUB7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ClcnkaQ9WUB7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ClcnkaQ9WUB7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ClcnkaQ9WUB7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ClcnkaQ9WUB7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ClcnkaQ9WUB7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ClcnkaQ9WUB7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ClcnkaQ9WUB7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ClcnkaQ9WUB7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ClcnkaQ9WUB7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ClcnkaQ9WUB7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClcnkaQ9WUB7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClcnkaQ9WUB7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClcnkaQ9WUB7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ClcnkaQ9WUB7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ClcnkaQ9WUB7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ClcnkaQ9WUB7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClcnkaQ9WUB7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ClcnkaQ9WUB7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ClcnkaQ9WUB7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ClcnkaQ9WUB7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ClcnkaQ9WUB7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClcnkaQ9WUB7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClcnkaQ9WUB7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClcnkaQ9WUB7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClcnkaQ9WUB7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ClcnkaQ9WUB7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClcnkaQ9WUB7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms