Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Vmn1r34G3XA52 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Vmn1r34G3XA52 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vmn1r34G3XA52 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vmn1r34G3XA52 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Vmn1r34G3XA52 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vmn1r34G3XA52 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vmn1r34G3XA52 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Vmn1r34G3XA52 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Vmn1r34G3XA52 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vmn1r34G3XA52 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vmn1r34G3XA52 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vmn1r34G3XA52 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vmn1r34G3XA52 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vmn1r34G3XA52 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Vmn1r34G3XA52 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Vmn1r34G3XA52 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vmn1r34G3XA52 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vmn1r34G3XA52 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vmn1r34G3XA52 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vmn1r34G3XA52 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vmn1r34G3XA52 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vmn1r34G3XA52 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vmn1r34G3XA52 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vmn1r34G3XA52 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vmn1r34G3XA52 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Vmn1r34G3XA52 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r34G3XA52 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vmn1r34G3XA52 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Vmn1r34G3XA52 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vmn1r34G3XA52 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vmn1r34G3XA52 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn1r34G3XA52 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r34G3XA52 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r34G3XA52 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vmn1r34G3XA52 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vmn1r34G3XA52 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vmn1r34G3XA52 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vmn1r34G3XA52 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vmn1r34G3XA52 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r34G3XA52 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r34G3XA52 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r34G3XA52 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r34G3XA52 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r34G3XA52 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r34G3XA52 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r34G3XA52 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r34G3XA52 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r34G3XA52 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r34G3XA52 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r34G3XA52 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r34G3XA52 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r34G3XA52 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r34G3XA52 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vmn1r34G3XA52 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r34G3XA52 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r34G3XA52 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r34G3XA52 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r34G3XA52 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r34G3XA52 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn1r34G3XA52 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r34G3XA52 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r34G3XA52 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r34G3XA52 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r34G3XA52 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r34G3XA52 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r34G3XA52 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r34G3XA52 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r34G3XA52 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r34G3XA52 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r34G3XA52 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r34G3XA52 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r34G3XA52 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r34G3XA52 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r34G3XA52 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r34G3XA52 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r34G3XA52 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r34G3XA52 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r34G3XA52 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r34G3XA52 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r34G3XA52 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r34G3XA52 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r34G3XA52 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r34G3XA52 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r34G3XA52 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vmn1r34G3XA52 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r34G3XA52 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r34G3XA52 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r34G3XA52 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r34G3XA52 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r34G3XA52 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r34G3XA52 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn1r34G3XA52 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r34G3XA52 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r34G3XA52 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r34G3XA52 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r34G3XA52 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r34G3XA52 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.9 ms