RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RAD18	Q9NS91	495 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ASTN1	O14525	1302 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NEMP2	A6NFY4	417 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RFXAP	O00287	272 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SCD	O00767	359 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MDM4	O15151	490 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	LIAS	O43766	372 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PNMT	P11086	282 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	AGA	P20933	346 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	S100G	P29377	79 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CD200	P41217	278 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CDH12	P55289	794 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ERVS71-1	P61550	626 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	E2F1	Q01094	437 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MICB	Q29980	383 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MSS51	Q4VC12	460 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SAXO2	Q658L1	398 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	DEF8	Q6ZN54	512 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PROSER1	Q86XN7	944 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM203	Q969S6	136 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TMBIM1	Q969X1	311 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SCMH1	Q96GD3	660 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SENP8	Q96LD8	212 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	WDFY2	Q96P53	400 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SYT17	Q9BSW7	474 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CHIA	Q9BZP6	476 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR51E2	Q9H255	320 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MED9	Q9NWA0	146 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RASD1	Q9Y272	281 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ISM1	B1AKI9	464 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072		M0R036	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	DSCR3	O14972	297 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	AZIN1	O14977	448 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CLIC2	O15247	247 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GRID2	O43424	1007 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NDUFB10	O96000	172 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	EGF	P01133	1207 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TCRB	P04435	133 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RPN2	P04844	631 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CHRM2	P08172	466 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NMB	P08949	121 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ENG	P17813	658 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RORC	P51449	518 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	HMGCS1	Q01581	520 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	AES	Q08117	197 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ECH1	Q13011	328 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CDK5R2	Q13319	367 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	IKZF1	Q13422	519 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	LIPM	Q5VYY2	423 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SP8	Q8IXZ3	490 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PIGB	Q92521	554 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	LENG9	Q96B70	501 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	C14orf79	Q96F83	325 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RDH12	Q96NR8	316 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR10A5	Q9H207	317 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NENF	Q9UMX5	172 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CMAHP	Q9Y471	501 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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