RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	BEM4	P39011	633 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SGM1	P47166	707 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	KXD1	P53158	218 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	HOT1	Q03213	719 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YLR407W	Q06070	228 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	RSC58	Q07979	502 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YOR352W	Q08816	343 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	LSO1	Q3E827	93 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	KEX2	P13134	814 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	COQ1	P18900	473 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	UBA2	P52488	636 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	PEX14	P53112	341 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	FDC1	Q03034	503 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YML131W	Q03102	365 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	INM2	Q05533	292 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SGD1	Q06132	899 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	GPA1	P08539	472 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SPL2	P38839	148 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MAD1	P40957	749 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	not detected
GPT2	YKR067W	SEC5	P89102	971 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YDR056C	Q12025	205 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	REC8	Q12188	680 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SPO16	P17122	198 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	BUD14	P27637	709 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MIC60	P36112	540 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SPC72	P39723	622 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	TOK1	P40310	691 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YKE2	P52553	114 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	ARP9	Q05123	467 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MRX10	Q05648	414 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	NDL1	Q06568	189 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	TAH18	Q12181	623 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YHL017W	P38745	532 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	VPS8	P39702	1274 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YER130C	P39959	443 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	ICP55	P40051	511 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	ROG3	P43602	733 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YPR097W	Q06839	1073 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	FAR1	P21268	830 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YHR131C	P38835	850 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	PCL7	P40186	285 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YJL070C	P40361	888 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	TMA108	P40462	946 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	PIP2	P52960	996 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SRC1	Q03707	834 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YDL073W	Q07454	984 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	HAP4	P14064	554 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MCM10	P32354	571 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	CNS1	P33313	385 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	RER2	P35196	286 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MRPL10	P36520	322 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	AKR1	P39010	764 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	FTR1	P40088	404 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YNL034W	P53963	612 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YNL018C	P53976	612 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	TIM50	Q02776	476 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	HIR2	P32480	875 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	KRE6	P32486	720 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	IML2	P47031	731 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MDE1	P47095	244 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SPR28	Q04921	423 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	REX3	Q12090	404 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	YLR125W	Q12138	136 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	IDI1	P15496	288 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	DAL1	P32375	460 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	PPQ1	P32945	549 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GPT2	YKR067W	MNR2	P35724	969 aa		6.22	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms