RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	PXL1	P36166	706 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	ISW1	P38144	1129 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	PPS1	P38148	807 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	PAN5	P38787	379 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	GAA1	P39012	614 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	NIT1	P40447	199 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	NDC80	P40460	691 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	KTR7	P40504	517 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	FMS1	P50264	508 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	MFM1	Q02783	413 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	SPO75	Q07798	868 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	YAP7	Q08182	245 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	HMI1	Q12039	706 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	RPC53	P25441	422 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	YGR117C	P53270	476 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	PLP2	Q12017	286 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MIA40	YKL195W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	YLR464W	P0CX17	216 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	MTF2	P10849	440 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	GAL2	P13181	574 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	DAL1	P32375	460 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	LTV1	P34078	463 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SIP3	P38717	1229 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	NDT80	P38830	627 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	ACA1	P39970	489 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	YEL076C	P39971	216 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	FET4	P40988	552 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	GUP1	P53154	560 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	PGA2	P53903	129 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	UME1	Q03010	460 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	RBA50	Q04418	439 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	OPY2	Q06810	360 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SPO12	P17123	173 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SRB4	P32569	687 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	PIH1	P38768	344 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	VFA1	P40080	203 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SEC9	P40357	651 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	YFL034W	P43564	1073 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	TOS3	P43637	560 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SMC3	P47037	1230 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	ERG5	P54781	538 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SML1	Q04964	104 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	HDA3	Q06623	655 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.13	□□□□□ -1.27	not detected
MIA40	YKL195W	WTM2	Q12206	467 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	ARP6	Q12509	438 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	DPB3	P27344	201 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	UTR2	P32623	467 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	NUP82	P40368	713 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	HFM1	P51979	1187 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	ORC4	P54791	529 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SEC5	P89102	971 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	RAD18	P10862	487 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	APL1	P27351	700 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	LYS5	P50113	272 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	LIF1	P53150	421 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	FUS2	Q05670	677 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	VAC14	Q06708	880 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	MED1	Q12321	566 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	RKM4	Q12504	494 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	MYO1	P08964	1928 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	STE11	P23561	717 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	YEL043W	P32618	956 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SMC1	P32908	1225 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	XRS2	P33301	854 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	NIP100	P33420	868 aa		7.1	□□□□□ -1.27

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