RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	REC104	P33323	182 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	AIM21	P40563	679 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	YDL121C	Q07541	149 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	GPB1	Q08886	897 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	HMI1	Q12039	706 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	RXT3	Q07458	294 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	TPO1	Q07824	586 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	SPE1	P08432	466 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	ENA1	P13587	1091 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	CDC20	P26309	610 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	PPG1	P32838	368 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	POA1	P38218	177 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	MET12	P46151	657 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	SPT20	P50875	604 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	YPR196W	Q06595	470 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	CIT2	P08679	460 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.72	□□□□□ -1.49	not detected
ACT1	YFL039C	ERP2	P39704	215 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	UBP5	P39944	805 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	ENV7	Q12003	364 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACT1	YFL039C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	EMC1	P25574	760 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	TIM23	P32897	222 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	TOD6	P34219	525 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	ATG19	P35193	415 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	HIS5	P07172	385 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	ERR1	P0CX10	437 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	ERR2	P0CX11	437 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	STE13	P33894	931 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	EMC3	P36039	253 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	CHA4	P43634	648 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	YAP6	Q03935	383 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	YOL057W	Q08225	711 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	MPH2	P0CD99	609 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	NUP82	P40368	713 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	GCV2	P49095	1034 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	YGL081W	P53156	320 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	GDH3	P39708	457 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	HOS4	P40480	1083 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	ALG2	P43636	503 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	ALG12	P53730	551 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	YLR125W	Q12138	136 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	YLR358C	O13565	187 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	FBP1	P09201	348 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	STE11	P23561	717 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	CAB3	P36076	571 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	FLR1	P38124	548 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	GYP8	P43570	497 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	IES1	P43579	692 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	MAL11	P53048	616 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	VPS30	Q02948	557 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	YLR224W	Q05947	369 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	NKP1	Q12493	238 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	PHO8	P11491	566 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	KAR1	P11927	433 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	NIT3	P49954	291 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	DAM1	P53267	343 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	HDA1	P53973	706 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	YKR011C	Q02209	353 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	ATP25	Q03153	612 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	DPB3	P27344	201 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	SPC29	P33419	253 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	LST4	P34239	828 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	BLI1	P35727	113 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	NCS6	P53088	359 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	COG4	Q06096	861 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	UPC2	Q12151	913 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ACT1	YFL039C	STE14	P32584	239 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ACT1	YFL039C	GRX4	P32642	244 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ACT1	YFL039C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
ACT1	YFL039C	ESC8	Q08119	714 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ACT1	YFL039C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
ACT1	YFL039C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51

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