RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C ATP25Q03153 612 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TLG1Q03322 224 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YKU80Q04437 629 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TDA9Q04545 1251 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C RGP1P16664 663 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C MSH1P25846 959 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C CMK1P27466 446 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C ADD66P36040 267 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TDA3P38758 523 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SSN3P39073 555 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C MRPL19P53875 158 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TEP1P53916 434 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SAS4Q04003 481 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TAF11Q04226 346 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YDR286CQ05530 114 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C GNT1Q12096 491 aa7.31□□□□□ -1.24
SHO1YER118C ADE8P04161 214 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SER1P33330 395 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YRO2P38079 344 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C NCL1P38205 684 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SRP72P38688 640 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C LRP1P38801 184 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C CCT3P39077 534 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C RGA1P39083 1007 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C VPS53P47061 822 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SKP1P52286 194 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C PCL10P53124 433 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C MOT3P54785 490 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C VTI1Q04338 217 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C HLR1Q04429 423 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YPL191CQ08930 360 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TAH18Q12181 623 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C HSP42Q12329 375 aa7.3□□□□□ -1.24
SHO1YER118C RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C MET8P15807 274 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C ERT1P38140 529 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C HXT6P39003 570 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C HXT7P39004 570 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TOK1P40310 691 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C IRC6P43615 237 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C BFA1P47113 574 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C ZIP2P53061 704 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C DAM1P53267 343 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C MET7Q08645 548 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C PGC1Q08959 321 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C GLO4Q12320 285 aa7.29□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-DR6P0CX70 440 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-ER1P0CX71 440 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-LR2P0CX72 440 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-PLP0CX73 440 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-JR1P0CX74 440 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-LR3P0CX75 440 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-ML2P0CX76 440 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C HCA4P20448 770 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C ACE2P21192 770 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C DAL7P21826 554 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C MLS1P30952 554 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C AFG2P32794 780 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C XRS2P33301 854 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C AFR1P33304 620 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C EMC3P36039 253 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SHM2P37291 469 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C RGD1P38339 666 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C ASK10P48361 1146 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C PRP43P53131 767 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TIM50Q02776 476 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-GR1Q12085 440 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C PSH1Q12161 406 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SMC6Q12749 1114 aa7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHO1YER118C LEU1P07264 779 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C FUS1P11710 512 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C HOP1P20050 605 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C CCR4P31384 837 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C NPL6P32832 435 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SLC1P33333 303 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C CCZ1P38273 704 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C NEM1P38757 446 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C JEM1P40358 645 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C RIC1P40395 1056 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C VHR1P40522 640 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SMK1P41808 388 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C MSN5P52918 1224 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C TAD1P53065 400 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C RKM2Q03942 479 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C RGA2Q06407 1009 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C HFI1Q12060 488 aa7.27□□□□□ -1.25
SHO1YER118C APM4Q99186 491 aa7.27□□□□□ -1.25
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