RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C CSE1P33307 960 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NUP120P35729 1037 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ERP2P39704 215 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C BUD7Q08754 746 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CIR2Q08822 631 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RPS3P05750 240 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SUI3P09064 285 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SEN2P16658 377 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TFC3P34111 1160 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TAF5P38129 798 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C REI1P38344 393 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TIF5P38431 405 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CAJ1P39101 391 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YHB1P39676 399 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C XKS1P42826 600 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ATG36P46983 293 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C KRE28Q04431 385 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TDA6Q06466 467 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MRL1Q06815 381 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C VAM6Q07468 1049 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YIG1Q08956 461 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SMC6Q12749 1114 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RPC34P32910 317 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C HSP78P33416 811 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MDJ1P35191 511 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MNR2P35724 969 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PIC2P40035 300 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SYG1P40528 902 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PXA1P41909 870 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CIR1P42940 261 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C GCN20P43535 752 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MEC3Q02574 474 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C AVO1Q08236 1176 aa3.43□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PAP1P29468 568 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MUM2P38236 366 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RSM25P40496 264 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PHB1P40961 287 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ILM1P47155 203 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C GCV1P48015 400 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ELA1P53861 379 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C EIS1Q05050 843 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CMS1Q07897 291 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YKL068W-AQ3E826 78 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ITR2P30606 609 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C EXO5P38289 585 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SAK1P38990 1142 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C GPD2P41911 440 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NCS2P53923 493 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YMR187CQ03236 431 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ARR2Q06597 130 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YOR352WQ08816 343 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PHM7Q12252 991 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C DNF1P32660 1571 aa3.42□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ADE3P07245 946 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RSC6P25632 483 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YKL063CP35725 167 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YBR242WP38331 238 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SLS1P42900 643 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C BFA1P47113 574 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SHE10P53075 577 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CTF4Q01454 927 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TLG2Q08144 397 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RKR1Q04781 1562 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C DED1P06634 604 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-DR6P0CX70 440 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-ER1P0CX71 440 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-LR2P0CX72 440 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-PLP0CX73 440 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-JR1P0CX74 440 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-LR3P0CX75 440 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-ML2P0CX76 440 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TUP1P16649 713 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ERS1P17261 260 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C VMA4P22203 233 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SAS3P34218 831 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ESL2P36168 1195 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PSY4P38193 441 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YFL066CP43538 392 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SNX4P47057 423 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NUP84P52891 726 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YNR063WP53749 607 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SRP1Q02821 542 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SNZ1Q03148 297 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TAF8Q03750 510 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NNT1Q05874 261 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C EST2Q06163 884 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C GAS5Q08193 484 aa3.41□□□□□ -1.86
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