RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 LAMB2P55268 1798 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 COL4A5P29400 1685 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 FZD9O00144 591 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 PDIA6Q15084 440 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 HACL1Q9UJ83 578 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 PROSER3Q2NL68 480 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 PARP10Q53GL7 1025 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 PASKQ96RG2 1323 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 ANXA1P04083 346 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 EPHX2P34913 555 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 GPC2Q8N158 579 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 JDP2Q8WYK2 163 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 LTBP1Q14766 1721 aa25.39■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 SLC51AQ86UW1 340 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 NLRP3Q96P20 1036 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 CNTNAP1P78357 1384 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 NECTIN2Q92692 538 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 NEUROD2Q15784 382 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 COPS6Q7L5N1 327 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAF4-216ENST00000586813 ABCC4O15439 1325 aa25.33■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 CHL1O00533 1208 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 KRT24Q2M2I5 525 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 RUNDC1Q96C34 613 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 TAF1P21675 1872 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 NLRP10Q86W26 655 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 TNS4Q8IZW8 715 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 NIM1KQ8IY84 436 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 CNTROBQ8N137 903 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 PPIP5K2O43314 1243 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 SCNN1DP51172 638 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 TCIRG1Q13488 830 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 AOC3Q16853 763 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAF4-216ENST00000586813 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 VPS33BQ9H267 617 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 BBOX1O75936 387 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 HOXB7P09629 217 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 EPS15P42566 896 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 VEGFBP49765 207 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 SP8Q8IXZ3 490 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 GRAPQ13588 217 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 RASSF10A6NK89 507 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 CAPN15O75808 1086 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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