RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 BCS1LQ9Y276 419 aa10.51□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 TNFRSF10BO14763 440 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 FAM157BP0CG42 384 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 IFT43Q96FT9 208 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 NDFIP2Q9NV92 336 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 STIM2Q9P246 746 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 WFS1O76024 890 aa10.49□□□□□ -0.73
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PDE4D-225ENST00000515835 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
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PDE4D-225ENST00000515835 TYRO3Q06418 890 aa10.47□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 LAMC2Q13753 1193 aa10.47□□□□□ -0.73
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PDE4D-225ENST00000515835 GPR25O00155 361 aa10.46□□□□□ -0.73
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PDE4D-225ENST00000515835 MICAL2O94851 1124 aa10.46□□□□□ -0.73
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PDE4D-225ENST00000515835 SERPINB4P48594 390 aa10.46□□□□□ -0.73
PDE4D-225ENST00000515835 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 SYNJ2O15056 1496 aa10.46□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 MAPTP10636 758 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 NPR3P17342 541 aa10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 TREML1Q86YW5 311 aa10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 CHD1O14646 1710 aa10.44□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 IDH3AP50213 366 aa10.44□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.44□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 SYNJ1O43426 1573 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 ICMTO60725 284 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 FAM13AO94988 1023 aa10.43□□□□□ -0.74
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PDE4D-225ENST00000515835 GAS6Q14393 721 aa10.43□□□□□ -0.74
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PDE4D-225ENST00000515835 BRD7Q9NPI1 651 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.43□□□□□ -0.74
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PDE4D-225ENST00000515835 MTMR3Q13615 1198 aa10.42□□□□□ -0.74
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PDE4D-225ENST00000515835 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 OPLAHO14841 1288 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 MPSTP25325 297 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-225ENST00000515835 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
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PDE4D-225ENST00000515835 HCN2Q9UL51 889 aa10.4□□□□□ -0.74
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PDE4D-225ENST00000515835 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 CTBSQ01459 385 aa10.38□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 KRT76Q01546 638 aa10.38□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 BMP4P12644 408 aa10.36□□□□□ -0.75
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