RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kcnj4P52189 445 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrrc8aQ80WG5 810 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Otud6bQ8K2H2 294 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Irx6Q9ER75 438 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krt85Q9Z2T6 507 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sp8Q8BMJ8 486 aa23.33■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa23.33■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Samd1D3YXK1 519 aa23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bicd2Q921C5 820 aa23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aox4Q3TYQ9 1336 aa23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Psme1P97371 249 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ddx11Q6AXC6 880 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ess2O70279 479 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Frat1P70339 274 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Irx2P81066 474 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Polr3dQ91WD1 398 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CemipQ8BI06 1361 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CoilQ5SU73 570 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cep57l1Q8VDS7 400 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ugt1a5B2RT14 529 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Map3k13Q1HKZ5 959 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ubash3aQ3V3E1 624 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ubxn10Q8BG34 277 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NalcnQ8BXR5 1738 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Osbpl5Q9ER64 874 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trpm3Q5F4S9 1721 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tgfb1i1Q62219 461 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bend3Q6PAL0 825 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vps33aQ9D2N9 598 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Exoc6bA6H5Z3 810 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ulbp1Q8HWA3 334 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Srgap1Q91Z69 1062 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Creld2Q9CYA0 350 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cnpy2Q9QXT0 182 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 IghaA0A0A6YXW6 389 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cnksr1A2A9K7 700 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cps1Q8C196 1500 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cfap58B2RW38 873 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ctdnep1Q3TP92 244 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ift57Q8BXG3 429 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ZwintQ9CQU5 252 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 RbsnQ80Y56 783 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atf7Q8R0S1 413 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atg3Q9CPX6 314 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Csrnp1P59054 583 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Txndc2Q6P902 515 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fez2Q6TYB5 348 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Surf1P09925 306 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cabp4Q8VHC5 271 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ano1Q8BHY3 960 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abcc4E9Q236 1325 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kcnk13Q8R1P5 405 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcdhb15Q91Y04 786 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Map2P20357 1828 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp317Q8C0Q5 607 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ubr1O70481 1757 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Camta1A2A891 1682 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Adcy9P51830 1353 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Znf335A2A5K6 1337 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tpm1P58771 284 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pde3bQ61409 1100 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MecomP14404 1042 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Usp28Q5I043 1051 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ano10Q8BH79 659 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slu7Q8BHJ9 585 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zkscan4Q5SZT6 480 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zbtb3Q91X45 518 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Odf2lQ9D478 642 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dip2bQ3UH60 1574 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AceP09470 1312 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dennd6aQ8BH65 605 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ptpn23Q6PB44 1692 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Clec11aO88200 328 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mdm2P23804 489 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tomm22Q9CPQ3 142 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnaaf4Q8R368 420 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fyb1O35601 819 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hook1Q8BIL5 728 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nlgn1Q99K10 843 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Echdc1Q9D9V3 322 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rnf20Q5DTM8 973 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 R3hcc1Q8BSI6 488 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ubxn4Q8VCH8 506 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 124.1 ms