RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SNX5Q9Y5X3 404 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SPACA6W5XKT8 324 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SPAG17Q6Q759 2223 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF17O60258 216 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10H3O60404 316 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FCMRO60667 390 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA7AO75326 666 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RDH16O75452 317 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GASTP01350 101 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PROS1P07225 676 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CPMP14384 443 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NT5EP21589 574 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BCKDHBP21953 392 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 POU1F1P28069 291 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PCSK6P29122 969 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ALDH4A1P30038 563 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC5A2P31639 672 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS6KA3P51812 740 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGA2P52926 109 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAPK10P53779 464 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RELAQ04206 551 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GNA13Q14344 377 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CEBPEQ15744 281 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF311Q5JNZ3 666 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 COLEC12Q5KU26 742 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DCST1Q5T197 706 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL35Q6PF15 583 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF605Q86T29 641 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 COMTD1Q86VU5 262 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SPARTQ8N0X7 666 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BBS10Q8TAM1 723 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NCSTNQ92542 709 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35A4Q96G79 324 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NODALQ96S42 347 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKHQ9HCJ1 492 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 AMBNQ9NP70 447 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FRRS1LQ9P0K9 344 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MKLN1Q9UL63 735 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMA1P25391 3075 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 VCANP13611 3396 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0G2JPF8 293 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DUXAA6NLW8 204 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 AQP9O43315 295 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FRS3O43559 492 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 AHCYL1O43865 530 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGA12O60330 932 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAN1A2O60476 641 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM20BO75063 409 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR1AP08908 422 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC159P0C7I6 412 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MSX1P28360 303 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FASLGP48023 281 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NPTX1Q15818 432 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MANEAQ5SRI9 462 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MLIPQ5VWP3 458 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 USP53Q70EK8 1073 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 VRK2Q86Y07 508 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 P3H2Q8IVL5 708 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CA13Q8N1Q1 262 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6T1Q8NGN1 323 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms