RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YEL020CP39994 560 aa1.38□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ELO3P40319 345 aa1.38□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RIA1P53893 1110 aa1.38□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ACM1Q08981 209 aa1.38□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UPC2Q12151 913 aa1.38□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CAF20P12962 161 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SED4P25365 1065 aa1.37□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MLS1P30952 554 aa1.37□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data1.37□□□□□ -2.19not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GEM1P39722 662 aa1.37□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MXR1P40029 184 aa1.37□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CRR1Q05790 422 aa1.36□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OSW1Q08692 278 aa1.36□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PGK1P00560 416 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERG11P10614 530 aa1.35□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EMP70P32802 667 aa1.35□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data1.35□□□□□ -2.19not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KAR5Q04746 504 aa1.35□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEX19Q07418 342 aa1.35□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CBR1P38626 284 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL206CP39529 758 aa1.34□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAC2P39937 518 aa1.34□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MTC3P53077 123 aa1.34□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATG1P53104 897 aa1.34□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLU7Q02775 382 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DAL4Q04895 635 aa1.34□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCW10Q04951 389 aa1.34□□□□□ -2.19
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TAF13P11747 167 aa1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MKK2P32491 506 aa1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLA2P33338 968 aa1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CTF13P35203 478 aa1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM21P38167 1117 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGL176CP46945 554 aa1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRC8P47046 822 aa1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSL2Q00578 843 aa1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADI1Q03677 179 aa1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP1P20676 1076 aa1.32□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STE14P32584 239 aa1.32□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAF1P41910 395 aa1.32□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL163CP46996 555 aa1.32□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ROD1Q02805 837 aa1.32□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLK19Q08581 821 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TAF3Q12297 353 aa1.32□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SYP1P25623 870 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CNN1P43618 361 aa1.31□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MUP1P50276 574 aa1.31□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GPI13Q07830 1017 aa1.31□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STP1Q00947 519 aa1.3□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRM11Q12463 433 aa1.3□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSA4P22202 642 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DBP2P24783 546 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GCS1P35197 352 aa1.29□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL109CQ02981 657 aa1.29□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SGO1Q08490 590 aa1.29□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SDS24P38314 527 aa1.28□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ENT3P47160 408 aa1.28□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR111WQ99210 232 aa1.28□□□□□ -2.2
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DBP5P20449 482 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APN1P22936 367 aa1.27□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC21P32074 935 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MPH1P40562 993 aa1.27□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FKH2P41813 862 aa1.27□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ENP2P48234 707 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIW14P53965 281 aa1.27□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GNT1Q12096 491 aa1.27□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS35P34110 944 aa1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CCT7P42943 550 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AMA1P50082 593 aa1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRK1P50873 501 aa1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR053CP53234 283 aa1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SMX3P54999 86 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRT1Q03175 343 aa1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NDD1Q08887 554 aa1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLL058WQ12198 575 aa1.26□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FUN30P31380 1131 aa1.25□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR053CP38235 358 aa1.25□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PNT1P38969 423 aa1.25□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIC2P40035 300 aa1.25□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ZAP1P47043 880 aa1.25□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MDM38Q08179 573 aa1.25□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SWM1Q12379 170 aa1.25□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GCD6P32501 712 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRC13Q08630 104 aa1.24□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OXR1Q08952 273 aa1.24□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TUB3P09734 445 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HIS7P33734 552 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GLG1P36143 616 aa1.23□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PXL1P36166 706 aa1.23□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MCM7P38132 845 aa1.23□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPP1P38786 293 aa1.23□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PSA1P41940 361 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TEL2P53038 688 aa1.23□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPC82P32349 654 aa1.22□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NDC80P40460 691 aa1.22□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBC9P50623 157 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LSC1P53598 329 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.8 ms