RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W APP1P53933 587 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W TCO89Q08921 799 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W BLI1P35727 113 aa11.04□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W PPS1P38148 807 aa11.04□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YBR062CP38239 180 aa11.04□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W BIM1P40013 344 aa11.04□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YIL001WP40560 513 aa11.04□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W VPS53P47061 822 aa11.04□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W FAR8Q05040 523 aa11.04□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YMR085WP0CF18 432 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SRV2P17555 526 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W CLB4P24871 460 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W KRE2P27809 442 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W ROG3P43602 733 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W JJJ2P46997 583 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W VPS4P52917 437 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W FOL1P53848 824 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W DOS2P54858 310 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YMR187CQ03236 431 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YMR018WQ04364 514 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W FIG2P25653 1609 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W VAN1P23642 535 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W PLC1P32383 869 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W PES4P39684 611 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W INA22P40576 216 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W MSN5P52918 1224 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W JJJ1P53863 590 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W PNP1Q05788 311 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YLH47Q06493 454 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W BDF2Q07442 638 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W GNT1Q12096 491 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W MED1Q12321 566 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W HIF1Q12373 385 aa11.03□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W TRP2P00899 507 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W POL3P15436 1097 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W GSY1P23337 708 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W RAM2P29703 316 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W RPC37P36121 282 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W ECM2P38241 364 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W NUP82P40368 713 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W HOS4P40480 1083 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W MDJ2P42834 146 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W NMD5P46970 1048 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W RIM8P53179 542 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W TDA9Q04545 1251 aa11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YLR462WO13556 202 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W IME1P21190 360 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W MVD1P32377 396 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W FRD1P32614 470 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W STE13P33894 931 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W TFC3P34111 1160 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W MMS21P38632 267 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YHL049CP38722 271 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YEL075CP39972 122 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YER189WP40104 122 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YFL064CP43540 174 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W HUL5P53119 910 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W ALR1Q08269 859 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YBL111CQ3E7Y5 667 aa11.01□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W KAR3P17119 729 aa11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W SRO9P25567 434 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W SEC20P28791 383 aa11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W DEF1P35732 738 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W BCH2P36122 765 aa11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W TIF5P38431 405 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W REV7P38927 245 aa11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W GUP1P53154 560 aa11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YNL144CP53907 740 aa11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YLR297WQ05899 129 aa11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W BUG1Q12191 341 aa11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W PEP5P12868 1029 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W ACE2P21192 770 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W BAS1P22035 811 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W RAD51P25454 400 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W EUG1P32474 517 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W ORC6P38826 435 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W PSY2P40164 858 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W AXL1P40851 1208 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YJL181WP46987 611 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W COS5P47187 383 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W NSG2P53898 299 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W MFM1Q02783 413 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 106.4 ms