RNA–Protein interactions for RNA: YOL076W

MDM20, Transcript of Non-catalytic subunit of the NatB N-terminal acetyltransferase, yeast

Gene MDM20, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM20	YOL076W	ACF2	Q12168	779 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MDM20	YOL076W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	MSS4	P38994	779 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	MCH5	Q08777	521 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	NGG1	P32494	702 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	PNT1	P38969	423 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	YFL054C	P43549	646 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	XYL2	Q07993	356 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	GUP2	Q08929	609 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	NPC2	Q12408	173 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SIN3	P22579	1536 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	ADE8	P04161	214 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SLA2	P33338	968 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	YAP1801	P38856	637 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	YML020W	Q03722	664 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	ADY3	Q07732	790 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	PUS2	P53167	370 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
MDM20	YOL076W	TOS4	Q06266	489 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	OMS1	Q06668	471 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SRM1	P21827	482 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	RNT1	Q02555	471 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	CRR1	Q05790	422 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	MDM38	Q08179	573 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SPR28	Q04921	423 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	MOH1	P38191	138 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	YER158C	P40095	573 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	YJR107W	P47145	328 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	KIN4	Q01919	800 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SWM1	Q12379	170 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	HXT13	P39924	564 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	CHA4	P43634	648 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	EXG2	P52911	562 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	HXT17	P53631	564 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	HXT15	P54854	567 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	CDC6	P09119	513 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	CDC34	P14682	295 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	ERG4	P25340	473 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	CHS7	P38843	316 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SRT1	Q03175	343 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	KCS1	Q12494	1050 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
MDM20	YOL076W	YDR306C	Q06640	478 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	YOL073C	Q08232	322 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	ATF1	P40353	525 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	BDF2	Q07442	638 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	FYV10	P40492	516 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	GNP1	P48813	663 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	DLT1	Q04216	342 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	CDA1	Q06702	301 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDM20	YOL076W	CDC11	P32458	415 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	YRO2	P38079	344 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	GDE1	Q02979	1223 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	YMR206W	Q03695	313 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	MET5	P47169	1442 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	SVF1	Q05515	481 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	PEX19	Q07418	342 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	KAR4	P25583	335 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	IRC10	Q08118	586 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	ALG7	P07286	448 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	GYP7	P48365	746 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	NIT3	P49954	291 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	HRQ1	Q05549	1077 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	LTE1	P07866	1435 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	ESP1	Q03018	1630 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	MRP8	P35719	219 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	GIC1	P38785	314 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	DMC1	P25453	334 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MDM20	YOL076W	SPC42	P36094	363 aa		2.68	□□□□□ -1.98

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