RNA–Protein interactions for RNA: YMR059W

SEN15, Transcript of Subunit of the tRNA splicing endonuclease, yeast

Gene SEN15, Length 387 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEN15	YMR059W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	CDC34	P14682	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	RPC82	P32349	654 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	GIC1	P38785	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	BUL1	P48524	976 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	EEB1	Q02891	456 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	SPO20	Q04359	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	OMS1	Q06668	471 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	MCH5	Q08777	521 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEN15	YMR059W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
SEN15	YMR059W	TIM44	Q01852	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	PET112	P33893	541 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	MET10	P39692	1035 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	ATF1	P40353	525 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	TMN2	Q04562	672 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	ACF2	Q12168	779 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	ERG4	P25340	473 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
SEN15	YMR059W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	ASF1	P32447	279 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	STB4	P50104	949 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	RNT1	Q02555	471 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	UPC2	Q12151	913 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	BDF2	Q07442	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	IRC10	Q08118	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEN15	YMR059W	SED4	P25365	1065 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	HEM3	P28789	327 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	MNR2	P35724	969 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	NPP2	P39997	493 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	SFB2	P53953	876 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	GYP7	P48365	746 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	YER158C	P40095	573 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	ALG7	P07286	448 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	STE14	P32584	239 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	SNM1	P40993	198 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	YGR053C	P53234	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	MTH1	P35198	433 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	ESC2	Q06340	456 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEN15	YMR059W	MUK1	Q02866	612 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	SPC42	P36094	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	MBP1	P39678	833 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	GND2	P53319	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	ERG5	P54781	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	VPS30	Q02948	557 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	PEX19	Q07418	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	AGP1	P25376	633 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
SEN15	YMR059W	DAS1	P47005	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	MET3	P08536	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	SDS3	P40505	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	TRM13	Q12383	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	PPH3	P32345	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	STE13	P33894	931 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	YHL017W	P38745	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	YKE2	P52553	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	DLT1	Q04216	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	FRE5	Q08908	694 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	TRM11	Q12463	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	FBP1	P09201	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	CTF13	P35203	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	SDP1	P40479	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	YML020W	Q03722	664 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	SWM1	Q12379	170 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEN15	YMR059W	ELO3	P40319	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEN15	YMR059W	TAF7	Q05021	590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEN15	YMR059W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEN15	YMR059W	ADE8	P04161	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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