RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	SFB2	P53953	876 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	SPS1	P08458	490 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	FUN30	P31380	1131 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	GYP8	P43570	497 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	MDM12	Q92328	271 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	RAD53	P22216	821 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	SCT1	P32784	759 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	YKE2	P52553	114 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	UGO1	Q03327	502 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	ENV7	Q12003	364 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.79	□□□□□ -1.48	not detected
RPC17	YJL011C	ADP1	P25371	1049 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	SPC29	P33419	253 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	PEX6	P33760	1030 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	TFB2	Q02939	513 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	RFC5	P38251	354 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	TOS1	P38288	455 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	YAP1801	P38856	637 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	DSS1	P39112	969 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	TY4A-J	P47023	414 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	DNM1	P54861	757 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	MED7	Q08278	222 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	OSW2	Q12202	724 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	SRM1	P21827	482 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	EMC3	P36039	253 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	ADR1	P07248	1323 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	VBA3	P25594	458 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	APL1	P27351	700 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	SIZ1	Q04195	904 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	IOC4	Q04213	475 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	YPR196W	Q06595	470 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	CDC9	P04819	755 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	HSP78	P33416	811 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	MPH2	P0CD99	609 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	GSY1	P23337	708 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	SRP101	P32916	621 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	ORC3	P54790	616 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	ATP25	Q03153	612 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	MSC2	Q03455	724 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	MET7	Q08645	548 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	TSR4	P25040	408 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	RPC82	P32349	654 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	CTH1	P47976	325 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	CMP2	P14747	604 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	SFP1	P32432	683 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.72	□□□□□ -1.49	not detected
RPC17	YJL011C	MTC2	P34246	357 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	NIT3	P49954	291 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	DAM1	P53267	343 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	YNL193W	P53870	558 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	RSM24	Q03976	319 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	RSC3	Q06639	885 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	CDA1	Q06702	301 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	YDL177C	Q12257	170 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPC17	YJL011C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	SRD1	P09007	221 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	PER1	P25625	357 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	GRX4	P32642	244 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	UBP12	P39538	1254 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	TAD1	P53065	400 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	YGL081W	P53156	320 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	ENV11	P53246	860 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	BRE4	Q07660	1125 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
RPC17	YJL011C	GAL10	P04397	699 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	MAC1	P35192	417 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	RAD18	P10862	487 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	DAL7	P21826	554 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	LIP5	P32875	414 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	STE13	P33894	931 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	YGR012W	P53206	393 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	YDR514C	Q04408	483 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	REH1	Q06709	432 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	HSF1	P10961	833 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	ENA1	P13587	1091 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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