RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	RSC1	P53236	928 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ENT1	Q12518	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RAD1	P06777	1100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	KTR6	P54070	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SSL2	Q00578	843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ECM11	Q04110	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SDH5	Q08230	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PCL8	Q08966	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PBS2	P08018	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RAD4	P14736	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PGS1	P25578	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TAF5	P38129	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YTA12	P40341	825 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	HAP4	P14064	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SIR1	P21691	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SNT1	P25357	1226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	EOS1	P53938	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RIM4	P38741	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PHM6	Q05637	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RMR1	P53060	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SRL4	Q03085	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ATP14	Q12349	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	DPH6	Q12429	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	VID28	P40547	921 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	LIF1	P53150	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	BUD7	Q08754	746 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SEY1	Q99287	776 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	VPH2	P32341	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	GTR1	Q00582	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PNG1	Q02890	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TFC8	Q12308	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	HO	P09932	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TGL4	P36165	910 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SNZ3	P43545	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TOM22	P49334	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SNZ2	P53824	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SWA2	Q06677	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	BUD14	P27637	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NUP82	P40368	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RIC1	P40395	1056 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PKP1	P40530	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	IML2	P47031	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MLC1	P53141	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TUB4	P53378	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	DON1	Q05610	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RAD34	Q06665	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CLB3	P24870	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SIC1	P38634	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YIL077C	P40508	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YIR042C	P40586	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YET3	Q07451	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MBP1	P39678	833 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PCL7	P40186	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SER2	P42941	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PEX21	P50091	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	HOL1	P53389	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PGA2	P53903	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ATG2	P53855	1592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	COX6	P00427	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RPN14	P53196	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YKU80	Q04437	629 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	LYP1	P32487	611 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TIP41	Q12199	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	WHI2	P12611	486 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NAM9	P27929	486 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.5 ms