RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-1

RDN25-1, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-1, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-1RDN25-1 YPQ2Q06328 317 aa10.3□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 YAP7Q08182 245 aa10.3□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 BOI1P38041 980 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data10.3□□□□□ -0.76not detected
RDN25-1RDN25-1 VFA1P40080 203 aa10.3□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 MON1P53129 644 aa10.3□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 BNI4P53858 892 aa10.3□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 THR4P16120 514 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 MAK31P23059 88 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 XRS2P33301 854 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 YHL050CP38721 697 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 MAL13P53338 473 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 NGL3Q03210 505 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 SLK19Q08581 821 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 PPR1P07272 904 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 YEL043WP32618 956 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 GFA1P14742 717 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 SRB4P32569 687 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 TPO2P53283 614 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 GDE1Q02979 1223 aa10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 RIB2Q12362 591 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 TYR1P20049 452 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 SPO11P23179 398 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 PET10P36139 283 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 YKR075CP36155 307 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 STB1P42845 420 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 CDC27P38042 758 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 SPL2P38839 148 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 BUD16P39988 312 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 YKL091CP33324 310 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 ATG14P38270 344 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 SET2P46995 733 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 FAP1P53971 965 aa10.28□□□□□ -0.76
RDN25-1RDN25-1 HIR1P32479 840 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 SEC6P32844 805 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 KAP123P40069 1113 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 GCN20P43535 752 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 CCM1P48237 864 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 GTR1Q00582 310 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 URH1Q04179 340 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 GNT1Q12096 491 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 RPL22AP05749 121 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 ETP1P38748 585 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 VID27P40157 782 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 GVP36P40531 326 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 UBA2P52488 636 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 RPT4P53549 437 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 ADY4Q05955 493 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 YIG1Q08956 461 aa10.27□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 CDC8P00572 216 aa10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 SEG2P34250 1132 aa10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 IOC3P43596 787 aa10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 SHE10P53075 577 aa10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 OM45P16547 393 aa10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 PCL10P53124 433 aa10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 VAM6Q07468 1049 aa10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 TAD1P53065 400 aa10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 GRE2Q12068 342 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 CIT1P00890 479 aa10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 RPN2P32565 945 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 MYO3P36006 1272 aa10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 SPP381P38282 291 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 SPO71Q03868 1245 aa10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 RMP1Q12530 201 aa10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 ARG4P04076 463 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 RNR3P21672 869 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 SEC20P28791 383 aa10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 HEH2Q03281 663 aa10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 VMA22P38784 181 aa10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 CSR1Q06705 408 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 YDL073WQ07454 984 aa10.25□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 REV7P38927 245 aa10.24□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 SYG1P40528 902 aa10.24□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 IRC4Q03036 179 aa10.24□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 UTP14Q04500 899 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 OCA6Q12454 224 aa10.24□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 ACP1P32463 125 aa10.24□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 SCS2P40075 244 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 BUD7Q08754 746 aa10.24□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 NUC1P08466 329 aa10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 ADH4P10127 382 aa10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 VMA2P16140 517 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 BCD1P38772 366 aa10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 RNR4P49723 345 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 NCS2P53923 493 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 MST1P07236 462 aa10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 ALG1P16661 449 aa10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 EFB1P32471 206 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 CNS1P33313 385 aa10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 JNM1P36224 373 aa10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 STT3P39007 718 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 FMP30Q02883 468 aa10.23□□□□□ -0.77
RDN25-1RDN25-1 NUR1Q12066 484 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.2 ms