RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 CCER2I3L3R5 266 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 PIK3R2O00459 728 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 SMTNP53814 917 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 TNP2Q05952 138 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 CHSY3Q70JA7 882 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 AIDAQ96BJ3 306 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 A0A1W2PNR3 127 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 NEFLP07196 543 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 CD33P20138 364 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 CHRNA4P43681 627 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 VAC14Q08AM6 782 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 FAM182BQ5T319 152 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 ADH6P28332 368 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 USP3Q9Y6I4 520 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 ITGB7P26010 798 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 ITGAEP38570 1179 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 ZIC5Q96T25 663 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 HFM1A2PYH4 1435 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 UACAQ9BZF9 1416 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 CDK2AP1O14519 115 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 ANP32CO43423 234 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 MTFR1Q15390 333 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 TOPBP1Q92547 1522 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 TONSLQ96HA7 1378 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 WDR97A6NE52 1622 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 A6NJY4 79 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 FAM157BP0CG42 384 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM11Q96F44 468 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 STRN4Q9NRL3 753 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 AKNAQ7Z591 1439 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 DOC2BQ14184 412 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 SAMD9Q5K651 1589 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 ABL2P42684 1182 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 CABP1Q9NZU7 370 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-212ENST00000580838 EFSO43281 561 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 PLVAPQ9BX97 442 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 MARK1Q9P0L2 795 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 GRIN2BQ13224 1484 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 PIK3CDO00329 1044 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 TXLNAP40222 546 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 SEMA3FQ13275 785 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 WASHC4Q2M389 1173 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 MDFIQ99750 246 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 GATA4P43694 442 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 LAMC2Q13753 1193 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms