RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362524.1

RNU6-600P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 600, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-600P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-600P-201ENST00000362524 PTPN5P54829 565 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 GTF2IP78347 998 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 POU5F1BQ06416 359 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 MTMR3Q13615 1198 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZNF394Q53GI3 561 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 RETREG3Q86VR2 466 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 HOMER1Q86YM7 354 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 APPBP2Q92624 585 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 GPRASP2Q96D09 838 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 MTA3Q9BTC8 594 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 C3orf80F5H4A9 247 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 GUCA2AQ02747 115 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PTK2Q05397 1052 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PNMA2Q9UL42 364 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 AK5Q9Y6K8 562 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 HRO43593 1189 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 MAN1A1P33908 653 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 CHMP4BP1P59074 171 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 LYPD8Q6UX82 237 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PPM1EQ8WY54 764 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 FEZ1Q99689 392 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 APBA2Q99767 749 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 HINFPQ9BQA5 517 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 KIAA1024Q9UPX6 916 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 SPG7Q9UQ90 795 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 CCDC189A1A4V9 331 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 IGHA2P01877 340 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 IGFBP4P22692 258 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 MPSTP25325 297 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 GNALP38405 381 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 BRD3Q15059 726 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ARMC2Q8NEN0 867 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 IL17RAQ96F46 866 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 IER2Q9BTL4 223 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 FANCLQ9NW38 375 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 SNTG2Q9NY99 539 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 EID1Q9Y6B2 187 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 SFI1A8K8P3 1242 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 GPR182O15218 404 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 MYL1P05976 194 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 USP5P45974 858 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 ST13P50502 369 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 EPHB1P54762 984 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PAK2Q13177 524 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 RAB33AQ14088 237 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PPP2R5AQ15172 486 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 Q3C1V9 767 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 KRT26Q7Z3Y9 468 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 TRPM4Q8TD43 1214 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 HLA-CQ95604 372 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 C12orf49Q9H741 205 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 GGT7Q9UJ14 662 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-600P-201ENST00000362524 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa4.72□□□□□ -1.65
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