RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r54K7N649 806 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r117K7N6V1 857 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nthl1O35980 300 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Grem1O70326 184 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Camk2bP28652 542 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcp4P63054 62 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gng8P63078 70 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tbx1P70323 479 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FapP97321 761 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 H2-M3Q31093 336 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm428Q3UTE2 360 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bbs12Q5SUD9 708 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nr0b2Q62227 260 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nudt6Q8CH40 313 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SbsnQ8CIT9 700 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Aspscr1Q8VBT9 550 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr854Q8VFF1 315 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Imp3Q921Y2 184 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rassf1Q99MK9 340 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ska2Q9CR46 120 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem88Q9D0N8 159 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zdhhc21Q9D270 265 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc38a3Q9DCP2 505 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DguokQ9QX60 277 aa8.94□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm28870A0A0A6YW38 222 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm10608E9PZ13 166 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TpbpaP13438 124 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Wnt3aP27467 352 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gas6Q61592 674 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nipa1Q8BHK1 323 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ssuh2Q8C3L1 340 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 B3gnt7Q8K0J2 397 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cacnb4Q8R0S4 519 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Art3Q8R2G4 371 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Asb7Q91ZU0 318 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmed9Q99KF1 235 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Med18Q9CZ82 208 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trmt10bQ9D075 318 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc15a1Q9JIP7 709 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mid2Q9QUS6 705 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prmt2Q9R144 448 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1375A0A0N4SUP0 313 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tox2A2A472 547 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp985A2A7A5 519 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ssxb6A2BI74 170 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp26P10076 861 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vps26aP40336 327 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Capza1P47753 286 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ptx3P48759 381 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CcnfP51944 777 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cdh8P97291 799 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fmo3P97501 534 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 InhbbQ04999 411 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 B4galnt2Q09199 510 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rpusd3Q14AI6 344 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc22a16Q497L8 649 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dhrs9Q58NB6 319 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Laptm5Q61168 261 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kiaa0895lQ810A5 467 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nipal3Q8BGN5 410 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fbxo30Q8BJL1 746 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lcmt2Q8BYR1 686 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 EndovQ8C9A2 338 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Faim2Q8K097 317 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 C8aQ8K182 587 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1499Q8VG65 314 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Emid1Q91VF5 444 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ogfod2Q9CQ04 349 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 1700029P11RikQ9CQ68 150 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gins1Q9CZ15 196 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ogfod3Q9D136 315 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q9D8N1 392 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q9D979 236 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lpar3Q9EQ31 354 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr27Q9EQ90 311 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Praf2Q9JIG8 178 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scube2Q9JJS0 997 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Txnrd2Q9JLT4 524 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrit3W8DXL4 681 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prrg1A2BFE8 218 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gsg1lD3Z7H4 322 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Btbd2E9PUS2 523 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm7945F6QI24 236 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm8020F6WLE9 229 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3633L7N233 213 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm9611L7N476 213 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RrhO35214 337 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PdgfrbP05622 1098 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ugt2b17P17717 530 aa8.93□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 HexbP20060 536 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.4 ms