Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Ssuh2Q8C3L1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ssuh2Q8C3L1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ssuh2Q8C3L1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ssuh2Q8C3L1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ssuh2Q8C3L1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ssuh2Q8C3L1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ssuh2Q8C3L1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ssuh2Q8C3L1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssuh2Q8C3L1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ssuh2Q8C3L1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ssuh2Q8C3L1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssuh2Q8C3L1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ssuh2Q8C3L1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ssuh2Q8C3L1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssuh2Q8C3L1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssuh2Q8C3L1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ssuh2Q8C3L1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssuh2Q8C3L1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssuh2Q8C3L1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ssuh2Q8C3L1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ssuh2Q8C3L1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ssuh2Q8C3L1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ssuh2Q8C3L1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ssuh2Q8C3L1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssuh2Q8C3L1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssuh2Q8C3L1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssuh2Q8C3L1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssuh2Q8C3L1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssuh2Q8C3L1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssuh2Q8C3L1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ssuh2Q8C3L1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssuh2Q8C3L1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssuh2Q8C3L1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ssuh2Q8C3L1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ssuh2Q8C3L1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ssuh2Q8C3L1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssuh2Q8C3L1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssuh2Q8C3L1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssuh2Q8C3L1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ssuh2Q8C3L1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ssuh2Q8C3L1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssuh2Q8C3L1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ssuh2Q8C3L1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssuh2Q8C3L1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssuh2Q8C3L1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssuh2Q8C3L1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssuh2Q8C3L1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssuh2Q8C3L1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ssuh2Q8C3L1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ssuh2Q8C3L1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ssuh2Q8C3L1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssuh2Q8C3L1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssuh2Q8C3L1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssuh2Q8C3L1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssuh2Q8C3L1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssuh2Q8C3L1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssuh2Q8C3L1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssuh2Q8C3L1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssuh2Q8C3L1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssuh2Q8C3L1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ssuh2Q8C3L1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ssuh2Q8C3L1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ssuh2Q8C3L1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ssuh2Q8C3L1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ssuh2Q8C3L1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssuh2Q8C3L1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssuh2Q8C3L1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssuh2Q8C3L1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssuh2Q8C3L1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssuh2Q8C3L1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssuh2Q8C3L1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssuh2Q8C3L1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssuh2Q8C3L1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ssuh2Q8C3L1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssuh2Q8C3L1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssuh2Q8C3L1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssuh2Q8C3L1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssuh2Q8C3L1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssuh2Q8C3L1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ssuh2Q8C3L1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssuh2Q8C3L1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssuh2Q8C3L1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssuh2Q8C3L1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssuh2Q8C3L1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ssuh2Q8C3L1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms