Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tmed9Q99KF1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmed9Q99KF1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmed9Q99KF1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tmed9Q99KF1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmed9Q99KF1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmed9Q99KF1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tmed9Q99KF1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmed9Q99KF1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmed9Q99KF1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmed9Q99KF1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmed9Q99KF1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmed9Q99KF1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmed9Q99KF1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmed9Q99KF1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmed9Q99KF1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmed9Q99KF1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmed9Q99KF1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmed9Q99KF1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmed9Q99KF1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmed9Q99KF1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmed9Q99KF1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmed9Q99KF1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmed9Q99KF1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmed9Q99KF1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmed9Q99KF1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmed9Q99KF1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tmed9Q99KF1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmed9Q99KF1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmed9Q99KF1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmed9Q99KF1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmed9Q99KF1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed9Q99KF1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmed9Q99KF1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmed9Q99KF1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmed9Q99KF1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmed9Q99KF1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmed9Q99KF1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmed9Q99KF1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed9Q99KF1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmed9Q99KF1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmed9Q99KF1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tmed9Q99KF1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmed9Q99KF1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed9Q99KF1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed9Q99KF1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmed9Q99KF1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmed9Q99KF1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmed9Q99KF1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmed9Q99KF1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmed9Q99KF1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmed9Q99KF1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmed9Q99KF1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmed9Q99KF1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmed9Q99KF1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmed9Q99KF1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmed9Q99KF1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmed9Q99KF1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmed9Q99KF1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmed9Q99KF1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmed9Q99KF1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmed9Q99KF1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmed9Q99KF1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmed9Q99KF1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed9Q99KF1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed9Q99KF1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed9Q99KF1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed9Q99KF1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmed9Q99KF1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmed9Q99KF1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmed9Q99KF1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed9Q99KF1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed9Q99KF1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed9Q99KF1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed9Q99KF1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmed9Q99KF1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed9Q99KF1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed9Q99KF1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed9Q99KF1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmed9Q99KF1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmed9Q99KF1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed9Q99KF1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed9Q99KF1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmed9Q99KF1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmed9Q99KF1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmed9Q99KF1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmed9Q99KF1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmed9Q99KF1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmed9Q99KF1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmed9Q99KF1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmed9Q99KF1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmed9Q99KF1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmed9Q99KF1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed9Q99KF1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed9Q99KF1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmed9Q99KF1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmed9Q99KF1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmed9Q99KF1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmed9Q99KF1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmed9Q99KF1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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