Protein–RNA interactions for Protein: Q04999

Inhbb, Inhibin beta B chain, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InhbbQ04999 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,78■■■□□ 2,84
InhbbQ04999 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
InhbbQ04999 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
InhbbQ04999 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
InhbbQ04999 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
InhbbQ04999 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
InhbbQ04999 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
InhbbQ04999 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
InhbbQ04999 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
InhbbQ04999 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
InhbbQ04999 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
InhbbQ04999 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
InhbbQ04999 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
InhbbQ04999 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
InhbbQ04999 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
InhbbQ04999 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
InhbbQ04999 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
InhbbQ04999 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
InhbbQ04999 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
InhbbQ04999 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
InhbbQ04999 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
InhbbQ04999 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
InhbbQ04999 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
InhbbQ04999 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
InhbbQ04999 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
InhbbQ04999 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
InhbbQ04999 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,54■■■□□ 2
InhbbQ04999 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
InhbbQ04999 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
InhbbQ04999 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
InhbbQ04999 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
InhbbQ04999 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
InhbbQ04999 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
InhbbQ04999 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
InhbbQ04999 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
InhbbQ04999 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
InhbbQ04999 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
InhbbQ04999 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
InhbbQ04999 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
InhbbQ04999 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
InhbbQ04999 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
InhbbQ04999 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
InhbbQ04999 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
InhbbQ04999 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
InhbbQ04999 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
InhbbQ04999 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
InhbbQ04999 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
InhbbQ04999 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
InhbbQ04999 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
InhbbQ04999 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
InhbbQ04999 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
InhbbQ04999 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
InhbbQ04999 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
InhbbQ04999 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,57■■□□□ 1,84
InhbbQ04999 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,56■■□□□ 1,84
InhbbQ04999 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
InhbbQ04999 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
InhbbQ04999 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
InhbbQ04999 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
InhbbQ04999 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
InhbbQ04999 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
InhbbQ04999 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
InhbbQ04999 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
InhbbQ04999 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
InhbbQ04999 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,15■■□□□ 1,78
InhbbQ04999 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
InhbbQ04999 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
InhbbQ04999 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
InhbbQ04999 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
InhbbQ04999 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
InhbbQ04999 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26■■□□□ 1,75
InhbbQ04999 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
InhbbQ04999 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
InhbbQ04999 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
InhbbQ04999 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
InhbbQ04999 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
InhbbQ04999 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
InhbbQ04999 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
InhbbQ04999 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
InhbbQ04999 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
InhbbQ04999 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
InhbbQ04999 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
InhbbQ04999 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
InhbbQ04999 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
InhbbQ04999 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
InhbbQ04999 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
InhbbQ04999 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
InhbbQ04999 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
InhbbQ04999 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
InhbbQ04999 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
InhbbQ04999 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
InhbbQ04999 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
InhbbQ04999 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
InhbbQ04999 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
InhbbQ04999 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
InhbbQ04999 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
InhbbQ04999 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
InhbbQ04999 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
InhbbQ04999 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
InhbbQ04999 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms