RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10800D3Z496 220 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex16F6WNY1 1150 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm11236J3QMS7 360 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mup4P11590 178 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csn1s1P19228 313 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aup1P70295 410 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dppa5bP85965 119 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alg10bQ3UGP8 474 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpeb2Q812E0 521 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc41a2Q8BYR8 573 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prokr2Q8K458 381 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ApofQ91V80 315 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem150aQ91WN2 271 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhga9Q91XX9 932 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AmnQ99JB7 458 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ms4a10Q99N03 267 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufv2Q9D6J6 248 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ClpxQ9JHS4 634 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alyref2Q9JJW6 218 aa15.45■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aadacl2B2RWD2 401 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10338K7N692 204 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il13ra1O09030 424 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rem1O35929 297 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxa2P31245 372 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rph3aP47708 681 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc42P60766 191 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpxcr1Q3V0P1 322 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt16Q7TN83 639 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Proser3Q7TSA6 634 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IpmkQ7TT16 396 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csgalnact1Q8BJQ9 530 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1469Q8VFW5 309 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lgals2Q9CQW5 130 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrepQ9QUR6 710 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc25a13Q9QXX4 676 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csf2P01587 141 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lsp1P19973 330 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pax3P24610 479 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cers1P27545 350 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TstP52196 297 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A1bgQ19LI2 512 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcp4l1Q6W8Q3 68 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AardQ811W1 167 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrtm2Q8BGA3 515 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Swi5Q8K3D3 89 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttll2A4Q9E4 540 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r106E9PY92 862 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp846G3X996 541 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fmo6J3QMN6 532 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DcnP28654 354 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pou2f3P31362 431 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ap1s1P61967 158 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ChatQ03059 641 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ClpbQ60649 677 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AptxQ7TQC5 342 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1051Q7TR76 308 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plekhs1Q8BW88 474 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r81Q8R286 306 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elf5Q8VDK3 253 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pla2g15Q8VEB4 412 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4f13Q99N19 523 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp5f1Q9CQQ7 256 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prps2Q9CS42 318 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hyal6Q9D4E9 494 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ap3m1Q9JKC8 418 aa15.44■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd12G5E893 2041 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr3P35413 330 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppm1aP49443 382 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Opn1swP51491 346 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syndig1lQ3USQ7 237 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpinf2Q61247 491 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GcgrQ61606 485 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr320Q7TRZ4 306 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo30Q8BJL1 746 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec4a3Q8JZX6 237 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlgap5Q8K4R9 808 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppil6Q9D6D8 278 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2010005H15RikQ9D8D6 97 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igkv12-46A0A140T8P6 115 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm12695A2AGB2 545 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14147A2AQX6 640 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp40B1B1D3 796 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ido1P28776 407 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MybphP70402 483 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam105aQ3TVP5 353 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajc11Q5U458 559 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1263Q8VG63 306 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgme1Q9CXC3 338 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pbdc1Q9D0B6 198 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nacc2Q9DCM7 586 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acsl4Q9QUJ7 711 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa15.43■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chst3O88199 472 aa15.42■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpx5P21765 221 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.7 ms