Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J6

Ndufv2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufv2Q9D6J6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,29■■■■□ 3,88
Ndufv2Q9D6J6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Ndufv2Q9D6J6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Ndufv2Q9D6J6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,22■■■■□ 3,07
Ndufv2Q9D6J6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Ndufv2Q9D6J6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Ndufv2Q9D6J6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Ndufv2Q9D6J6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Ndufv2Q9D6J6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Ndufv2Q9D6J6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Ndufv2Q9D6J6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Ndufv2Q9D6J6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Ndufv2Q9D6J6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Ndufv2Q9D6J6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Ndufv2Q9D6J6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Ndufv2Q9D6J6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Ndufv2Q9D6J6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Ndufv2Q9D6J6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Ndufv2Q9D6J6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Ndufv2Q9D6J6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Ndufv2Q9D6J6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Ndufv2Q9D6J6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Ndufv2Q9D6J6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Ndufv2Q9D6J6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Ndufv2Q9D6J6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Ndufv2Q9D6J6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Ndufv2Q9D6J6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Ndufv2Q9D6J6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Ndufv2Q9D6J6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Ndufv2Q9D6J6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Ndufv2Q9D6J6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Ndufv2Q9D6J6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Ndufv2Q9D6J6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Ndufv2Q9D6J6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Ndufv2Q9D6J6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Ndufv2Q9D6J6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Ndufv2Q9D6J6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Ndufv2Q9D6J6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Ndufv2Q9D6J6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Ndufv2Q9D6J6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ndufv2Q9D6J6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ndufv2Q9D6J6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ndufv2Q9D6J6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ndufv2Q9D6J6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ndufv2Q9D6J6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Ndufv2Q9D6J6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ndufv2Q9D6J6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ndufv2Q9D6J6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Ndufv2Q9D6J6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ndufv2Q9D6J6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ndufv2Q9D6J6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ndufv2Q9D6J6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Ndufv2Q9D6J6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ndufv2Q9D6J6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ndufv2Q9D6J6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ndufv2Q9D6J6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ndufv2Q9D6J6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ndufv2Q9D6J6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ndufv2Q9D6J6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Ndufv2Q9D6J6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ndufv2Q9D6J6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ndufv2Q9D6J6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ndufv2Q9D6J6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ndufv2Q9D6J6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ndufv2Q9D6J6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ndufv2Q9D6J6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ndufv2Q9D6J6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Ndufv2Q9D6J6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ndufv2Q9D6J6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Ndufv2Q9D6J6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ndufv2Q9D6J6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ndufv2Q9D6J6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ndufv2Q9D6J6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ndufv2Q9D6J6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Ndufv2Q9D6J6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ndufv2Q9D6J6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ndufv2Q9D6J6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Ndufv2Q9D6J6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ndufv2Q9D6J6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ndufv2Q9D6J6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Ndufv2Q9D6J6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ndufv2Q9D6J6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ndufv2Q9D6J6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ndufv2Q9D6J6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ndufv2Q9D6J6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ndufv2Q9D6J6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ndufv2Q9D6J6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ndufv2Q9D6J6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ndufv2Q9D6J6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ndufv2Q9D6J6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ndufv2Q9D6J6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ndufv2Q9D6J6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ndufv2Q9D6J6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ndufv2Q9D6J6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ndufv2Q9D6J6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ndufv2Q9D6J6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ndufv2Q9D6J6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ndufv2Q9D6J6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ndufv2Q9D6J6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ndufv2Q9D6J6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms