Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Syndig1lQ3USQ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Syndig1lQ3USQ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Syndig1lQ3USQ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Syndig1lQ3USQ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Syndig1lQ3USQ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Syndig1lQ3USQ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Syndig1lQ3USQ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Syndig1lQ3USQ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Syndig1lQ3USQ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Syndig1lQ3USQ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Syndig1lQ3USQ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Syndig1lQ3USQ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syndig1lQ3USQ7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syndig1lQ3USQ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Syndig1lQ3USQ7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syndig1lQ3USQ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syndig1lQ3USQ7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syndig1lQ3USQ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syndig1lQ3USQ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Syndig1lQ3USQ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Syndig1lQ3USQ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Syndig1lQ3USQ7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Syndig1lQ3USQ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syndig1lQ3USQ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syndig1lQ3USQ7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syndig1lQ3USQ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Syndig1lQ3USQ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syndig1lQ3USQ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Syndig1lQ3USQ7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Syndig1lQ3USQ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Syndig1lQ3USQ7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syndig1lQ3USQ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syndig1lQ3USQ7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syndig1lQ3USQ7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Syndig1lQ3USQ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syndig1lQ3USQ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Syndig1lQ3USQ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syndig1lQ3USQ7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syndig1lQ3USQ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syndig1lQ3USQ7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Syndig1lQ3USQ7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syndig1lQ3USQ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syndig1lQ3USQ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syndig1lQ3USQ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syndig1lQ3USQ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syndig1lQ3USQ7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syndig1lQ3USQ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syndig1lQ3USQ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syndig1lQ3USQ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syndig1lQ3USQ7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syndig1lQ3USQ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syndig1lQ3USQ7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Syndig1lQ3USQ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syndig1lQ3USQ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Syndig1lQ3USQ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syndig1lQ3USQ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syndig1lQ3USQ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syndig1lQ3USQ7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syndig1lQ3USQ7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syndig1lQ3USQ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syndig1lQ3USQ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syndig1lQ3USQ7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syndig1lQ3USQ7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syndig1lQ3USQ7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syndig1lQ3USQ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syndig1lQ3USQ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syndig1lQ3USQ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syndig1lQ3USQ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syndig1lQ3USQ7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syndig1lQ3USQ7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syndig1lQ3USQ7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syndig1lQ3USQ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syndig1lQ3USQ7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Syndig1lQ3USQ7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syndig1lQ3USQ7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syndig1lQ3USQ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syndig1lQ3USQ7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syndig1lQ3USQ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syndig1lQ3USQ7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syndig1lQ3USQ7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syndig1lQ3USQ7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syndig1lQ3USQ7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syndig1lQ3USQ7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syndig1lQ3USQ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syndig1lQ3USQ7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syndig1lQ3USQ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syndig1lQ3USQ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syndig1lQ3USQ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syndig1lQ3USQ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Syndig1lQ3USQ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms