Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,22■■■■□ 3,55
Hoxa2P31245 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Hoxa2P31245 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Hoxa2P31245 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Hoxa2P31245 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,16■■■□□ 2,74
Hoxa2P31245 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Hoxa2P31245 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Hoxa2P31245 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Hoxa2P31245 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Hoxa2P31245 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Hoxa2P31245 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Hoxa2P31245 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Hoxa2P31245 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Hoxa2P31245 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Hoxa2P31245 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Hoxa2P31245 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Hoxa2P31245 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Hoxa2P31245 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Hoxa2P31245 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Hoxa2P31245 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Hoxa2P31245 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Hoxa2P31245 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Hoxa2P31245 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Hoxa2P31245 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Hoxa2P31245 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Hoxa2P31245 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Hoxa2P31245 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Hoxa2P31245 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Hoxa2P31245 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
Hoxa2P31245 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Hoxa2P31245 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Hoxa2P31245 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Hoxa2P31245 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Hoxa2P31245 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Hoxa2P31245 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Hoxa2P31245 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Hoxa2P31245 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Hoxa2P31245 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Hoxa2P31245 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Hoxa2P31245 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Hoxa2P31245 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Hoxa2P31245 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Hoxa2P31245 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Hoxa2P31245 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Hoxa2P31245 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Hoxa2P31245 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Hoxa2P31245 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Hoxa2P31245 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Hoxa2P31245 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Hoxa2P31245 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Hoxa2P31245 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Hoxa2P31245 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Hoxa2P31245 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Hoxa2P31245 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Hoxa2P31245 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Hoxa2P31245 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Hoxa2P31245 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Hoxa2P31245 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Hoxa2P31245 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Hoxa2P31245 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Hoxa2P31245 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Hoxa2P31245 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Hoxa2P31245 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Hoxa2P31245 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Hoxa2P31245 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Hoxa2P31245 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Hoxa2P31245 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Hoxa2P31245 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Hoxa2P31245 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Hoxa2P31245 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Hoxa2P31245 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Hoxa2P31245 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Hoxa2P31245 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Hoxa2P31245 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Hoxa2P31245 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Hoxa2P31245 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Hoxa2P31245 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Hoxa2P31245 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Hoxa2P31245 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Hoxa2P31245 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Hoxa2P31245 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Hoxa2P31245 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Hoxa2P31245 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Hoxa2P31245 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Hoxa2P31245 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Hoxa2P31245 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Hoxa2P31245 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Hoxa2P31245 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Hoxa2P31245 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Hoxa2P31245 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Hoxa2P31245 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Hoxa2P31245 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Hoxa2P31245 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Hoxa2P31245 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Hoxa2P31245 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Hoxa2P31245 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Hoxa2P31245 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Hoxa2P31245 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Hoxa2P31245 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Hoxa2P31245 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms