Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Zfp846G3X996 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Zfp846G3X996 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zfp846G3X996 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zfp846G3X996 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Zfp846G3X996 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Zfp846G3X996 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Zfp846G3X996 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Zfp846G3X996 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Zfp846G3X996 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Zfp846G3X996 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Zfp846G3X996 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Zfp846G3X996 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Zfp846G3X996 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Zfp846G3X996 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Zfp846G3X996 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Zfp846G3X996 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Zfp846G3X996 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Zfp846G3X996 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Zfp846G3X996 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Zfp846G3X996 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Zfp846G3X996 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Zfp846G3X996 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Zfp846G3X996 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Zfp846G3X996 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Zfp846G3X996 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Zfp846G3X996 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Zfp846G3X996 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Zfp846G3X996 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Zfp846G3X996 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Zfp846G3X996 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Zfp846G3X996 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zfp846G3X996 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Zfp846G3X996 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Zfp846G3X996 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zfp846G3X996 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zfp846G3X996 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Zfp846G3X996 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zfp846G3X996 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zfp846G3X996 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zfp846G3X996 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zfp846G3X996 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zfp846G3X996 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zfp846G3X996 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zfp846G3X996 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zfp846G3X996 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zfp846G3X996 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zfp846G3X996 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zfp846G3X996 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zfp846G3X996 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Zfp846G3X996 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zfp846G3X996 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zfp846G3X996 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Zfp846G3X996 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zfp846G3X996 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zfp846G3X996 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp846G3X996 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zfp846G3X996 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Zfp846G3X996 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Zfp846G3X996 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zfp846G3X996 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zfp846G3X996 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zfp846G3X996 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zfp846G3X996 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zfp846G3X996 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zfp846G3X996 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zfp846G3X996 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zfp846G3X996 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zfp846G3X996 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zfp846G3X996 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zfp846G3X996 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zfp846G3X996 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp846G3X996 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp846G3X996 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp846G3X996 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp846G3X996 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp846G3X996 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp846G3X996 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zfp846G3X996 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp846G3X996 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp846G3X996 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp846G3X996 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zfp846G3X996 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfp846G3X996 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Zfp846G3X996 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zfp846G3X996 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp846G3X996 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp846G3X996 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp846G3X996 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp846G3X996 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp846G3X996 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp846G3X996 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfp846G3X996 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfp846G3X996 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfp846G3X996 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp846G3X996 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp846G3X996 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp846G3X996 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp846G3X996 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp846G3X996 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms