Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM7

Nacc2, Nucleus accumbens-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nacc2Q9DCM7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
Nacc2Q9DCM7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Nacc2Q9DCM7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Nacc2Q9DCM7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Nacc2Q9DCM7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Nacc2Q9DCM7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Nacc2Q9DCM7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Nacc2Q9DCM7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Nacc2Q9DCM7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Nacc2Q9DCM7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Nacc2Q9DCM7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Nacc2Q9DCM7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nacc2Q9DCM7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Nacc2Q9DCM7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Nacc2Q9DCM7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nacc2Q9DCM7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Nacc2Q9DCM7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Nacc2Q9DCM7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Nacc2Q9DCM7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Nacc2Q9DCM7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Nacc2Q9DCM7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Nacc2Q9DCM7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Nacc2Q9DCM7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Nacc2Q9DCM7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Nacc2Q9DCM7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Nacc2Q9DCM7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Nacc2Q9DCM7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Nacc2Q9DCM7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Nacc2Q9DCM7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Nacc2Q9DCM7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Nacc2Q9DCM7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Nacc2Q9DCM7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Nacc2Q9DCM7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Nacc2Q9DCM7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Nacc2Q9DCM7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Nacc2Q9DCM7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Nacc2Q9DCM7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Nacc2Q9DCM7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Nacc2Q9DCM7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Nacc2Q9DCM7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Nacc2Q9DCM7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Nacc2Q9DCM7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Nacc2Q9DCM7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Nacc2Q9DCM7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,05
Nacc2Q9DCM7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Nacc2Q9DCM7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Nacc2Q9DCM7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Nacc2Q9DCM7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Nacc2Q9DCM7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Nacc2Q9DCM7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Nacc2Q9DCM7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Nacc2Q9DCM7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Nacc2Q9DCM7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Nacc2Q9DCM7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Nacc2Q9DCM7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Nacc2Q9DCM7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Nacc2Q9DCM7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Nacc2Q9DCM7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
Nacc2Q9DCM7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Nacc2Q9DCM7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Nacc2Q9DCM7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Nacc2Q9DCM7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Nacc2Q9DCM7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Nacc2Q9DCM7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Nacc2Q9DCM7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Nacc2Q9DCM7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Nacc2Q9DCM7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Nacc2Q9DCM7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Nacc2Q9DCM7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Nacc2Q9DCM7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Nacc2Q9DCM7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Nacc2Q9DCM7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Nacc2Q9DCM7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Nacc2Q9DCM7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Nacc2Q9DCM7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Nacc2Q9DCM7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Nacc2Q9DCM7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Nacc2Q9DCM7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Nacc2Q9DCM7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Nacc2Q9DCM7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Nacc2Q9DCM7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Nacc2Q9DCM7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Nacc2Q9DCM7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Nacc2Q9DCM7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Nacc2Q9DCM7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Nacc2Q9DCM7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Nacc2Q9DCM7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Nacc2Q9DCM7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Nacc2Q9DCM7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Nacc2Q9DCM7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Nacc2Q9DCM7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Nacc2Q9DCM7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Nacc2Q9DCM7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Nacc2Q9DCM7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Nacc2Q9DCM7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nacc2Q9DCM7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Nacc2Q9DCM7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Nacc2Q9DCM7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Nacc2Q9DCM7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Nacc2Q9DCM7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,2 ms