Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,77■■■■□ 3,64
Ap1s1P61967 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Ap1s1P61967 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Ap1s1P61967 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ap1s1P61967 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,36■■■□□ 2,93
Ap1s1P61967 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Ap1s1P61967 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Ap1s1P61967 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Ap1s1P61967 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Ap1s1P61967 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Ap1s1P61967 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Ap1s1P61967 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Ap1s1P61967 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Ap1s1P61967 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Ap1s1P61967 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Ap1s1P61967 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Ap1s1P61967 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Ap1s1P61967 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Ap1s1P61967 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Ap1s1P61967 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Ap1s1P61967 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Ap1s1P61967 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Ap1s1P61967 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Ap1s1P61967 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Ap1s1P61967 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Ap1s1P61967 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
Ap1s1P61967 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Ap1s1P61967 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Ap1s1P61967 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,58■■■□□ 2,49
Ap1s1P61967 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Ap1s1P61967 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Ap1s1P61967 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ap1s1P61967 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ap1s1P61967 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ap1s1P61967 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ap1s1P61967 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ap1s1P61967 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ap1s1P61967 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ap1s1P61967 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ap1s1P61967 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ap1s1P61967 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ap1s1P61967 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ap1s1P61967 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ap1s1P61967 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Ap1s1P61967 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ap1s1P61967 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ap1s1P61967 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ap1s1P61967 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ap1s1P61967 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ap1s1P61967 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ap1s1P61967 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ap1s1P61967 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Ap1s1P61967 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ap1s1P61967 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ap1s1P61967 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Ap1s1P61967 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ap1s1P61967 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ap1s1P61967 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ap1s1P61967 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ap1s1P61967 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ap1s1P61967 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ap1s1P61967 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ap1s1P61967 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ap1s1P61967 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Ap1s1P61967 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ap1s1P61967 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ap1s1P61967 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ap1s1P61967 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ap1s1P61967 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ap1s1P61967 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ap1s1P61967 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ap1s1P61967 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ap1s1P61967 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Ap1s1P61967 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ap1s1P61967 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ap1s1P61967 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ap1s1P61967 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Ap1s1P61967 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ap1s1P61967 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Ap1s1P61967 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ap1s1P61967 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ap1s1P61967 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ap1s1P61967 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ap1s1P61967 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ap1s1P61967 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ap1s1P61967 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ap1s1P61967 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Ap1s1P61967 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ap1s1P61967 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ap1s1P61967 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ap1s1P61967 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ap1s1P61967 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ap1s1P61967 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Ap1s1P61967 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ap1s1P61967 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ap1s1P61967 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ap1s1P61967 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ap1s1P61967 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ap1s1P61967 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ap1s1P61967 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,8 ms