RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	OPRL1	P41146	370 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CDH12	P55289	794 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C21orf58	P58505	322 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SELENOW	P63302	87 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4F2	P78329	520 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ITGAD	Q13349	1161 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FAM124A	Q86V42	546 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	REPS1	Q96D71	796 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PLXNA2	O75051	1894 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	RGS10	O43665	173 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TLL1	O43897	1013 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PRNP	P04156	253 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FUT4	P22083	530 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PCGF2	P35227	344 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	BMPR1A	P36894	532 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TGFBR1	P36897	503 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SCARB2	Q14108	478 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CLCA4	Q14CN2	919 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	OTUB2	Q96DC9	234 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	REV3L	O60673	3130 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FGB	P02675	491 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	LCK	P06239	509 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	IL3	P08700	152 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FURIN	P09958	794 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SPIB	Q01892	262 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	OCA2	Q04671	838 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FAHD1	Q6P587	224 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZNX1	250 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	P3H2	Q8IVL5	708 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SLC5A8	Q8N695	610 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TAMM41	Q96BW9	452 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	IL23A	Q9NPF7	189 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152		M0R3G1	203 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	JUND	P17535	347 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	DGKE	P52429	567 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PNLIPRP1	P54315	467 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NCS1	P62166	190 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	12.54	□□□□□ -0.4	2e-6	■■■□□ 18.8
BRF1-222	ENST00000635152	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TEAD4	Q15561	434 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	DNASE1L2	Q92874	299 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SGPP1	Q9BX95	441 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SELENON	Q9NZV5	590 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152		M0R129	80 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ADRB3	P13945	408 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	IDUA	P35475	653 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT6	P53370	316 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FPGS	Q05932	587 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SYT16	Q17RD7	645 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		12.54	□□□□□ -0.4

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