RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M YKE2P52553 114 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL138CP53122 345 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M MET13P53128 600 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR035CP53222 116 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SDA1P53313 767 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M CNM67P53865 581 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PGA2P53903 129 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM23Q02710 187 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M GDE1Q02979 1223 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR090CQ03193 310 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M OYE2Q03558 400 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YML020WQ03722 664 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PHM6Q05637 104 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR455WQ06188 304 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YLH47Q06493 454 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SLK19Q08581 821 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M CIT2P08679 460 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M TRL1P09880 827 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M WHI2P12611 486 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M MSD1P15179 658 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M FRS2P15625 503 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PPZ1P26570 692 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M RME1P32338 300 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SLX1P38324 304 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M UBX7P38349 436 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ERC1P38767 581 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO22P40511 975 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YIR016WP40572 265 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M MGA2P40578 1113 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD6P41697 788 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M OYE3P41816 400 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M MAF1P41910 395 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M BRE2P43132 505 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M LAM5P43560 674 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M AVT1P47082 602 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ALT2P52892 507 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR014WP53719 212 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL134CP53912 376 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SKY1Q03656 742 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SMC5Q08204 1093 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M TOM70P07213 617 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M THR4P16120 514 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX1P24004 1043 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SIS1P25294 352 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SRO9P25567 434 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M RAM2P29703 316 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC21P32074 935 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M EFT1P32324 842 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M OPY1P38271 328 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M APM2P38700 605 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YHL026CP38740 315 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PIH1P38768 344 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M CCC2P38995 1004 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M STT3P39007 718 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M XDJ1P39102 459 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M FIS1P40515 155 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M CTF18P49956 741 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M STB4P50104 949 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M RET3P53600 189 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL034WP53963 612 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M FAP1P53971 965 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL018CP53976 612 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M MFM1Q02783 413 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M COQ9Q05779 260 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M MMR1Q06324 491 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M OSW2Q12202 724 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M HIF1Q12373 385 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PCD1Q12524 340 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SMC6Q12749 1114 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M NBL1Q3E7Y6 73 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM29P38737 1868 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SNF1P06782 633 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SRD1P09007 221 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M MATALPHA2P0CY08 210 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M HMLALPHA2P0CY09 210 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M TAF13P11747 167 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M DBP5P20449 482 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M RSA4P25382 515 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M COQ8P27697 501 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M TMT1P32643 299 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PET10P36139 283 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M RFC5P38251 354 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD16P39988 312 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ESL1P40456 1118 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M FYV10P40492 516 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M JJJ3P47138 172 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PIL1P53252 339 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M RTT102P53330 157 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M NCS2P53923 493 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ROD1Q02805 837 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M DOT1Q04089 582 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ADY4Q05955 493 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ESC8Q08119 714 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M HFI1Q12060 488 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR022CQ12204 715 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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