RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J YKE2P52553 114 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL138CP53122 345 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MET13P53128 600 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR035CP53222 116 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SDA1P53313 767 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CNM67P53865 581 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PGA2P53903 129 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM23Q02710 187 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J GDE1Q02979 1223 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR090CQ03193 310 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J OYE2Q03558 400 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YML020WQ03722 664 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PHM6Q05637 104 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR455WQ06188 304 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YLH47Q06493 454 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SLK19Q08581 821 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CIT2P08679 460 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J TRL1P09880 827 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J WHI2P12611 486 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MSD1P15179 658 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J FRS2P15625 503 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PPZ1P26570 692 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RME1P32338 300 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SLX1P38324 304 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J UBX7P38349 436 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ERC1P38767 581 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO22P40511 975 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YIR016WP40572 265 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MGA2P40578 1113 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD6P41697 788 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J OYE3P41816 400 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MAF1P41910 395 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J BRE2P43132 505 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J LAM5P43560 674 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J AVT1P47082 602 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ALT2P52892 507 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR014WP53719 212 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL134CP53912 376 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SKY1Q03656 742 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SMC5Q08204 1093 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J TOM70P07213 617 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J THR4P16120 514 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX1P24004 1043 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SIS1P25294 352 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SRO9P25567 434 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RAM2P29703 316 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC21P32074 935 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J EFT1P32324 842 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J OPY1P38271 328 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J APM2P38700 605 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL026CP38740 315 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PIH1P38768 344 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CCC2P38995 1004 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J STT3P39007 718 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J XDJ1P39102 459 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J FIS1P40515 155 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CTF18P49956 741 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J STB4P50104 949 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RET3P53600 189 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL034WP53963 612 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J FAP1P53971 965 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL018CP53976 612 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J MFM1Q02783 413 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J COQ9Q05779 260 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MMR1Q06324 491 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J OSW2Q12202 724 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J HIF1Q12373 385 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PCD1Q12524 340 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SMC6Q12749 1114 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J NBL1Q3E7Y6 73 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM29P38737 1868 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SNF1P06782 633 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SRD1P09007 221 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MATALPHA2P0CY08 210 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J HMLALPHA2P0CY09 210 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF13P11747 167 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP5P20449 482 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RSA4P25382 515 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J COQ8P27697 501 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J TMT1P32643 299 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PET10P36139 283 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RFC5P38251 354 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD16P39988 312 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ESL1P40456 1118 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J FYV10P40492 516 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J JJJ3P47138 172 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PIL1P53252 339 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RTT102P53330 157 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J NCS2P53923 493 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ROD1Q02805 837 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J DOT1Q04089 582 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ADY4Q05955 493 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ESC8Q08119 714 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J HFI1Q12060 488 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR022CQ12204 715 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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